Knossos war die wichtigste Stadt auf Kreta vor der römischen Zeit und das Zentrum der ersten brillanten europäischen Zivilisation, der Minoan. Der Palast der Stadt ist die meistbesuchte archäologische Stätte auf Kreta mit über 1.000.000 Besuchern pro Jahr.
Die archäologische Stätte von Malia liegt 3 km östlich von Malia, neben dem Feuchtgebiet der Gegend und ganz in der Nähe des Strandes. Das war eine wichtige minoische Stadt und beherbergte den drittgrößten minoischen Palast, nach Knossos und Phaestus. Nach der Mythologie herrschte Sarpedon hier, der Bruder von Minos und Sohn von Zeus und Europa war. Sarpedon wurde von seinem Bruder Minos vertrieben und nahm dann in Indien in Kleinasien Zuflucht.
Die archäologische Stätte von Gortyn (oder Gortys) liegt 45 km südlich von Heraklion, in der Nähe des Dorfes Agii Deka und neben der Straße, die Agii Deka mit Mires verbindet. Die Stadt bedeckte eine große Fläche entlang des Flusses Mitropolianos (oder Litheos) mit ausgedehnten Olivenhainen.
Die alte Eleftherna liegt 25 km südöstlich von Rethymno, in der Nähe des Klosters von Arkadi. Die Stadt ist die bedeutendste archäologische Stätte in der Präfektur Rethymno, die nicht vollständig ausgegraben wurde und es wird erwartet, dass Archäologen viel mehr Entdeckungen machen. Die ersten organisierten Ausgrabungen begannen hier 1985 von der Universität Kreta.
Die antike Stadt Aptera wurde im 8. Jahrhundert v. Chr. in einer Panorama-Lage gegründet, die die Souda-Bucht kontrollierte und in der hellenistischen Zeit blühte. Sie wurde in den arabischen Jahren aufgegeben, als sie von den Piraten (oder einem Erdbeben) zerstört wurde.
Psira ist eine kleine unbewohnte Insel, die 1 Meile nördlich von Tholos Strand liegt und am nordöstlichen Rand des Golfs von Mirabello liegt. In Psira wurde eine minoische Siedlung von 15-20 Hektar gefunden, an einem der bedeutendsten Orte auf Kreta.
Alte Lappa wurde in der Nähe der heutigen Stadt Argyroupolis, 27 km südlich von Rethymno gebaut. Das Gebiet ist heute berühmt für seine Quellen mit Wasserfällen, seine alten Mühlen und die üppige grüne Landschaft, die Tausende von Besuchern jedes Jahr anzieht.
Zakros liegt in einem abgelegenen östlichen Gebiet von Kretas, 45 km südöstlich von Sitia. Die Kommunikation mit dem Mittleren Osten war von hier aus während des minoischen Zeitalters schneller, so dass die Minoer hier das Verwaltungszentrum des östlichen Kretas mit einem wichtigen Hafen bauten.