Heraklion beherbergt viele Schluchten, von denen die meisten die Bereiche von Psiloritis und Asterousia kreuzen. Asterousia hat wunderbare Wanderschluchten, die wichtigsten sind Agiofarago, Martsalo und Trafoulas. Allerdings ist die berühmteste Schlucht Gafaris bei Psiloritis. Sie überquert das herrliche Eichenholz von Rouvas. Andere Schluchten von Psiloritis sind die Schlucht von Kroussonas, durch die der minoische Weg zur Idaeischen Höhle führt, die Schlucht Vromonero, die Schlucht Vorizano und die beiden kleinen Schluchten von Asites (Saint Charalambos und Saint Anthony). In der Nähe von Heraklion Stadt gibt es die üppigen Schluchten von Karteros, Kounavi, Sylamos, Almyros und Venerato. Die westlichen Hänge des Lassithi-Gebirges beherbergen die Schluchten von Roza, Ambelos, Apotyposi und den Fluss Aposelemis von Hersonissos.
Abgesehen von erreichbaren Schluchten, ist Heraklion die Heimat von einigen sehr beliebten technischen Schluchten wie die imposante Schlucht von Arvi, die nach einem 80m hohen Fall zu einem dunklen unterirdischen Fluss wird. Besonders das Gebiet von Tsoutsouras und Keratokambos ist die Heimat von vielen steilen Schluchten, die mit Schrauben und Anker ausgestattet wurden.
Aposelemis Schlucht 
Die Schlucht Aposelemis verlässt die Siedlung Agrianá (oder Adrianna, wie ihre Bewohner sie nennen). Das ist die längste und wichtigste geologische Schlucht im nördlichen Teil der Präfektur von Heraklion. Sie wird durch den Fluss Aposelemis gekreuzt, aber der Teil der Schlucht hat Wasser nur nach starkem Regen, obgleich der Fluss in der Höhe das Wasser während aller nassen Monate hat (wegen des Phyllitbodens).
Die Schlucht von Agios Nikolaos, Gafaris oder Rouvas wird durch die Gipfel der Ambelakia von Osten und Samari von Westen begrenzt. Dies ist die wichtigste Schlucht von Psiloritis und zentral Kreta und nahm ihren Namen von der gleichnamigen byzantinischen Kirche im Südeingang.
Agiofarago Schlucht (bedeutet Schlucht der Heiligen) befindet sich im Süden von Odigitria Kloster und wurde in der Nähe von Betten von zwei Bächen geformt. Der erste Bach beginnt nordöstlich von Gyalomonochoro und der andere beginnt nordöstlich von Odigitria. Die beiden Quellen treffen sich in der Nähe von St. Kiriaki und nach einem relativ glatten Weg westlich und südlich der Kirche St. Kiriaki kommen sie in Porofarango an, wo die Hauptschlucht von Agiofarago beginnt und am libyschen Meer, an einem kleinen aber faszinierenden Strand, endet.
Die Schlucht von Trypiti wurde im Gebiet Asterousia, im Süden des Dorfes Vassiliki, gebildet. Die Länge der Schlucht erreicht 4 km und ein schöner Kiesstrand wird an ihrem Ausgang gebildet. Der Strand ist durch eine unbefestigte Straße erreichbar, die hoch entlang der östlichen Seite der Schlucht für mehrere Kilometer führt, bevor sie ihr Flussbett erreicht, kurz vor dem Ausgang zum Meer.
Im Westen des Dorfes Ano Asites läuft der Fluss zunächst durch die Schlucht von Hl. Haralabos und dann überquert das Dorf und läuft bald in eine tiefe und spektakuläre Schlucht, die Schlucht des heiligen Antonius. Sie können die Abfahrt finden, die zu dem Bett der Schlucht führt, neben der malerischen byzantinischen Kirche Hl. Anthony, wo es eine Quelle von Trinkwasser gibt.
Kounaviano Schlucht ist die reichste (in der Vegetation) Schlucht in der Präfektur von Heraklion, eine echte Oase im Zentrum der Provinz Pediada. Der Name stammt aus dem Dorf Kounavi. Das ist ein Nebenfluss des Flusses Karteros und verläuft parallel zur Astrakiano Schlucht, die in der Position Kaki Rachi von Skalani zusammenführt und dann die Schlucht von Karteros bildet.
Es gibt mehrere Orte auf Kreta, die schön sind, aber nur einige von ihnen können als Krone der Natur beschrieben werden. Ein Ort, der ein echtes Wunder der Natur ist, ist die Schlucht von Arvi, die den Arvion Berg in zwei Teile teilt, über die der Schrein von Zeus Arveios hörbar wurde. Die Schluchten von Arvi und Cha sind die zwei beeindruckendsten Schluchten Kretas.
Astrakiano und Kounaviano sind zwei üppige grüne Schluchten von Heraklion, die sich in der Nähe des Dorfes Skalani verschmelzen und ihren vereinigten Kurs bis Karteros weiterführen. Die Gesamtlänge der beiden Schluchten beträgt etwa 21 km. Die Schluchten befinden sich östlich der Stadt Heraklion und gehören zum größeren Gebiet von Jiouktas und der Schlucht von Agia Irini.
