Das archäologische Museum von Kissamos wurde 2005 gegründet und befindet sich im venezianisch-türkischen Denkmal, bekannt als Diikitirio ("Hauptquartier"). Seine Exponate bilden ein Längsbild der Geschichte der Region von der Vorgeschichte bis zur Spätantike, d.h. die frühen christlichen Zeiten. Die Ausstellung wird in Abschnitte unterteilt, die auf chronologischen und lokalen Kriterien basieren und den Boden und den ersten Stock des Gebäudes abdecken.
Im Erdgeschoss werden die minoischen Erkenntnisse aus den Ausgrabungen in Nopigia vorgestellt (Geometrische Periode, 9.-8. Jh. V. Chr.) und konzentriert sich auf die historische Entwicklung der großen Städte des westlichen Kretas: Polyrrhenien und Falassarna aus der hellenistischen Zeit (4. Jh BC). Es präsentiert auch Töpferwaren und keramische Erkenntnisse aus kleineren Ortstädten und Siedlungen der Region, hellenistische Inschriften und Skulpturen aus dem Gebiet von Kissamos, die hauptsächlich aus der Römerzeit stammen (67 v.Chr. - 4. Jh. N. Chr.).
Der erste Stock wird der Stadt Kissamos gewidmet und die Erkenntnisse stammen aus lokalen Ausgrabungen. Hier kann man Mosaikböden mit interessanten bildlichen Darstellungen aus städtischen Villen der griechischen Kisamos, Amphoren und Münzen aus dem Handel bewundern, Erkenntnisse aus Werkstätten, Alltagsgegenstände und Erkenntnisse aus Gräbern von Falassarna und Polirinia, ein Begräbnis der zweiten Hälfte des 4. Jahrhunderts v. Chr , vom römischen und frühchristlichen Friedhof.