Археологическое значение Крита можно оценить, посетив музеи и посмотрев богатые археологические коллекции. В Археологическом музее Ираклиона хранятся наиболее важные находки времен минойской цивилизации. Сокровища древних времен — от неолита до римской эпохи — можно увидеть также в археологических музеях Ханьи, Ретимно, Ситии, Киссамоса и Арханеса. В ближайшие годы откроются новые музеи в долине Месара и в районе древнего города Элефтерны, а музей в Агиос-Николаос закроется на реконструкцию. Важные коллекции местных археологических находок также представлены в Иерапетре, Милатосе и Гази.
Исторический музей Крита позволяет составить общее представление об истории и культуре острова с раннехристианских времен до XX века, а на временных выставках демонстрируются предметы византийского или современного искусства, а также рассказывается о знаменитых греческих деятелях и важных событиях. В городе Ханья располагается Исторический архив Крита, где хранится более 1700 исторических коллекций, а также Морской музей, второй по величине в Греции, помогающий сохранить славные морские традиции острова. В Византийских музеях Ираклиона, Ханьи и Ретимно представлены обширные коллекции в основном церковного искусства.
Военные коллекции и архивы хранят память о сопротивлении и борьбе критян против разных захватчиков. Можно особо отметить Военный музей в Хромонастири в Ретимно, исторический музей в Воризии, Музеи национального сопротивления в Терисо и Ираклионе, Исторический музей в Керамии, Музей Скалидиса в Перволии, Военный музей в Аскифу и Военную коллекцию музея Аргираки в Эпископи. Кроме того, важными историческими памятниками являются немецкие туннели возле поселка Платаниас и ворота Макаси в Ираклионе.
Музеи и коллекции, посвященные жизни и работе великих критских художников, писателей и политиков, можно найти во всех уголках Крита. Для посетителей открыты дома и музеи, посвященные государственному деятелю Элефтериосу Веднизелосу: дом, где он родился, в Мурниесе, дом, где он жил, в Халепе, Исторический музей в Терисо и Музей Венизелоса в деревне Агиос Георгиос. Очень интересный музей, посвященный знаменитому писателю Никосу Казанзакису, работает в его родном поселке Миртия. Можно также посетить дом, где по преданию родился великий критский художник Эль Греко, в Фоделе, а также Вифлеемские ворота в крепостных стенах Ираклиона, где выставленные предметы, использовавшиеся при съемках фильма «Эль Греко». Примечателен и мемориальный музей писателя Иоанниса Кондилакиса в Вианосе.
Стоит также посетить естественно-научные музеи, такие как Музей естественной истории, Критский аквариум в Гурнесе, Музеи критских трав и рыболовства в Колимбари, Геологический музей в Заросе и Химический музей в Ханье. Среди прочих музеев Крита следует также упомянуть Музей классического транспорта в Эксо Лаконии, Музей национальной спортивной команды и Музей типографии в Ханье, Музей музыкальных инструментов в Худетси, Музей восковых фигур в Зониане, Музей школьной жизни в Нерокуросе и Музей акритов Европы в Палеохоре.
Большинство критских музеев посвящены повседневной жизни обитателей острова, и в них можно увидеть предметы сельского обихода. Любопытные фольклорные коллекции представлены в музеях «Лихностатис» в Херсониссосе, Ханье, Вори, Аролитосе, Тилиссосе, Ретимно, Агиос-Николаос, Ситии, Венье, Терисо, Гавалохори, Пископиано, Соматасе, Ини, Аситесе, Хандрасе, Канданосе, Палекастро, Врахасси, Гавдосе, Пефки, Хамези, Мохосе, Спили и других городах и деревнях. Традиционные мельницы в Закросе и Хромонастири также открыты для посетителей. Выращиванию оливковых деревьев посвящены Музей оливы в Гувесе и старые маслозаводы в Арханесе и Ватолакосе.
С 2009 года Музей современного искусства Крита, площадью 1000м2, ставший центральным местом проведения выставок современного искусства, после расширения и реставрационных работ пришел на смену старой муниципальной галерее Л.Канакиса" (1992 г) и Центра Современного Искусства (1995г).
Живой музей исторической памяти, который следует посетить каждому гостю Крита, увековечивает страдания греческого народа во время немецкой оккупации находится в галереях Платаниас.
Музей оливок в Вувес расположен в традиционном строении в деревне Ано Вувес, в котором сохранены все особенности местной архитектуры.
Археологическая коллекция Малевизи представлена более 500 старинных объектов, датируемых всеми эпохами критской античности. Большая часть выставки представлена экспонатами из коллекции Метаксас, поддерживаемой Николаосом Метаксосом с 1959 по 1997.
Музей химии города Ханья представляет собой первую публичную химическую Лабораторию Греции и расположился на втором этаже Генеральной лаборатории Ханья.
Хромонастари - это очень красивая деревушка у подножья Врисины. По все деревушке можно найти множество строений венецианской архитектуры, но самым крупным и величественным из них считается так называемая Вилла Клаудио - внушительный особняк, из которого сделали военный музей.
Историко-фольклорный музей Ретимно был основан в 1973 году для сбора и исследования фольклорного материала региона. С 1995 года музей располагается в городском здании венецианского типа 17 века по адресу 28-30 Вернаду Стрит.
Музей древней Элефтерны - первый музей на Крите, расположенный в месте археологических раскопок, рядом с древним городом Элефтерна. Три зала музея вмещают всю историю города-государства Элефтерны от 3000 до н.э. до 1300 г. н.э., представляя как предметы быта, так и произведения искусства.
