Изолированность Крита от других континентальных регионов Европы, Азии и Африки повлияла на генетическое разнообразие местной фауны. Взять, к примеру, критского горного козла или дикую кошку, критскую землеройку, эндемичных членистоногих или летучих мышей — фауна Крита скрывает множество секретов об эволюции видов восточного Средиземноморья.
На острове нет животных, опасных для человека. Древние критяне объясняли это подвигом Геракла, который таким образом хотел почтить место рождения Зевса, либо благословением апостола Павла, два года прожившего на Крите.
Птичья фауна острова по праву считается одной из самых богатых в Европе: здесь зарегистрировано более 350 видов пернатых. В горах Крита гнездится крупнейшая в мире островная популяция грифов. Кроме того, здесь обитают последние пары бородачей на Балканском полуострове.