После освобождения Крита от арабов Никифором Фокой в 961 году н. э. начался период возрождения, о котором свидетельствуют многочисленные памятники и который продолжался и после прихода венецианцев.
Именно тогда было основано большинство ныне действующих малых и крупных монастырей. Они выполняли не только религиозную функцию, но и сыграли важную роль в борьбе критян против захватчиков, особенно после завоевания Крита Османской империей.
Монастыри были единственным местом, где христиане могли найти убежище и подготовить военные операции. Заподозрив, что монахи поддерживают повстанцев, османы разрушили несколько монастырей, служивших крупными революционными центрами.
Даже сегодня посетителей поражает рассказ о геноциде в монастыре Аркади в 1866 году. Осажденные христиане решили взорвать бочки с порохом, чтобы не сдаваться в плен османам. Похожие истории о событиях тех времен можно услышать во многих монастырях.
Монастырь Всех св. Лутраки 
Монастырь основан в 1972 году, находится восточнее от Ираклиона на растоянии 16-18 км, до монастыря св. Ирины (Крусон).
Монастырь основан в 1989 году, находится в 15 км от Ираклиона, до деревни Родиа, на высоте 90 м. Ктиторы монастыря являются митрополит Петрас Нектариос и Агапи Сбоку. Храм построен в стиле базилика, есть фрески в алтарной части и около купольное пространство. Освящен в честь Ведения во Храм Пресвятой Богородицы, престольный день 21 Ноября.
Монастырь расположен на скалистом подъеме между деревнями Сгурокефали и Самбас, в 23 км от Ираклиона. Этот мужской монастырь, разделенный на две части , одна из которых посвящена Св. Мине (престольный день 11 ноября), другая - Успению Пресвятой Богородицы(престольный день 15 августа), является одним из старейших монастырей на острове Крит.
Монастырь Святой Ирины очень древний, возможно, он был основан еще в конце периоде венецианское оккупации на Крите. Это очень живописный монастырь, располагающийся в чудесной местности на горе.
Монастырь Святого Георгия Горголаиниса находится на высоте 480 м рядом с деревней Аситес, в 24 км к югу от Ираклиона. Он располагается в покрытой буйной зеленью местностью, поросшей огромными платанами, кипарисами и дубами. Интересно, что один платан и кипарис на территории монастыря являются охраняемыми памятниками природы.
Один из известных монастырей Крита, известный с православной и исторической стороны, но не сильно посещаемый из-за своего расположения. Святой Ставропигиальный монастырь Богородицы Путеводительницы (Панагия Одигитрия) находится на южном берегу Крита, юго-восточнее Маталы, на горном плато Астерусия.
Он находится в районе Фанеромени, в 60 км от Ираклиона. Монастырь был построен во второй византийский период. Небольшая византийская часовня была расписана фресками, но их большая часть сейчас разрушена. Часовня долгое время пустовала, однако позже была чудесным образом найдена небольшая икона Благовещения Пресвятой Богородицы и монастырь стал местом поклонения поломников.
Монастырь расположен на возвышенности (550 метров над уровнем моря) в 18 км к западу от деревни Агиа Варвара. Монастырь Врондисиу был основан до 1204 года , в документах же упоминается начиная с 1400 г. Это был один из важнейших центров монашеской и духовной жизни на Крите.
