Kreta wird vom restlichen Festland Europas, Asiens und Afrikas isoliert, was sich in der genetischen Vielfalt der Fauna stark widerspiegelt. Von dem stolzen kretischen Steinbock, dem Luchs und der stacheligen Maus bis zu den endemischen Arthropoden und Fledermäusen von Kreta, hält die Fauna von Kreta viele Geheimnisse über die Evolution der Arten.
Es gibt keine gefährlichen Säugetiere für Menschen auf Kreta, im Gegensatz zu anderen Orten Griechenlands. Tatsächlich haben die alten Griechen diesen Mangel an großen Säugetieren wie Bären, Wölfen, Schakalen und giftigen Schlangen zugeschrieben, auf die Arbeit des Herkules (der den kretischen Stier lebendig in den Peloponnes brachte), der den Geburtsort des Zeus ehren wollte, indem er alle "schädlichen" und "giftigen" Tiere entfernte. Später glaubten die Kreter, dass die Insel von dem Apostel Paulus, der zwei Jahre lang auf Kreta lebte, mit den Exorzismen und Segnungen geräumt wurde.
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Kretische Wildkatze 
Die geheimnisvolle wilde Katze von Kreta (Felis silvestris cretensis) oder Fourogatos ist eine endemische Unterart der europäischen Wildkatze. Sie können einige Leute hören, die sich auf sie als den kretischen Luchs beziehen, obwohl sie nicht zu derselben Familie gehört. Das ist die einzige wilde Katze auf der Insel, die auf einen kleinen Teil von Kreta beschränkt wird.
Nagetiere sind die zweitgrößte Gruppe von Säugetieren auf Kreta, nach Fledermäusen. Abgesehen von den Igeln, den Haselmäusen, den kretischen Stachelmäusen, die in verschiedenen Artikeln beschrieben worden sind, hat Kreta die ländlichen Waldmäuse (Apodemus sylvaticus), die breitgezahnten Feldmäuse (Apodemus mystacinus), die Mäuse der Stadtmauer (Mus musculus ), die braune Ratte (Rattus norvegicus) und die schwarze Ratte (Rattus rattus).
Die stolze kretische Wildziege (wissenschaftl. Capra aegagrus creticus), auch bekannt als agrimi, wilde Ziege oder kretischer Steinbock ist eine endemische Unterart der wilden Ziege, ist die einzige Art von Steinbock in Europa. Entsprechend den genetischen Merkmalen wurde die wilde Ziege auf Kreta aus Asien eingeführt und kam dann mit den gewöhnlichen Ziegen auf der Insel in Berührung, während sie viele der genetischen Eigenschaften ihrer asiatischen Cousinen beibehielten.
Das Pferd von Messara, oder sonst Georgalidiko, Giorgalidiko oder kretisches Pferd ist eine heimische Pferdezucht aus Kreta, die nicht anderswo auf der Welt existiert. Die Rasse existiert auf der Insel zumindest seit der preminoischen Ära, weil ein Pferdeskelett in Ausgrabungen gefunden wurde, die vor 1700 v. Chr. zurückreicht und somit als die älteste Rasse in Europa gilt.
Der kretische Steinmarder ist ein schöner Säugetier, baumartig, Nachteule, Fleisch- und Fruchtfresser, der alleine (außer der Paarungszeit) in Felsspalten, in Baumhöhlen, in von Raubtieren verlassenen Nestern, in wüsten unterirdischen Galerien, in spärlichen Wäldern, in buschigen Orten und in Schluchten lebt.
CKreta, abgesehen von isolierten Wäldern und den vielen verlassenen Bauernhäusern, hat mehr als 2000 Höhlen, die in mehr als 5000 mit kleinen Hohlräumen zunehmen. So war es immer ein idealer Ort für fliegende Säugetiere, Fledermäuse, die in den Wäldern, alten Häusern und Höhlen Zuflucht finden. Mehrere Arten wurden bereits auf der Insel identifiziert und nummeriert mehr als die Hälfte der Insel Säugetierarten.
Igel werden häufig auf der Insel Kreta getroffen, die zu zwei verschiedenen Arten gehören, Erinaceus concolor und Erinaceus roumanicus. Leider werden sie als eine Delikatesse angesehen und es gibt einige Fälle auf Kreta, wenn diese Tiere gegessen wurden (hauptsächlich von Roma-Leuten). Schließlich werden die Igel als heilige Tiere von der griechischen Kirche wegen der charakteristischen Art der Paarung betrachtet, die an Menschen erinnert.
Der Dachs von Kreta oder Arkalos (Meles Arcalus) ist eine endemische Unterart des gemeinsamen Dachs. Das ist ein fleischfressendes Säugetier, das einem Bären mit kurzen Beinen und einem relativ langen Körper (70-95 Zentimeter) und einem kurzen Schwanz (15 Zentimeter) ähnelt. Es hat einen kurzen, dicken und rauen Mantel, der silberweiß an der Rückseite, an Seiten und am Schwanz ist.
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