Для сложного рельефа острова характерно обилие пещер.
На карте отмечено более 4500 пещер и карстовых воронок, и опытные спелеологи могут исследовать их и познакомиться с их богатым животным миром.
Крит очень интересен для геологов, что подтверждается многочисленным международными спелеологическими экспедициями по поиску неисследованных пещер и воронок. Всемирно известны пропасти Гургутакас (глубочайшая в Греции — 1208 м), Леон (глубиной 1110 м) и другие. Среди исследователей пещер особой популярностью пользуются гора Струмбулас возле Ираклиона, геопарк возле Ситии, геопарк горы Псилоритис и район Мелидони в Белых горах.
На острове много спелеологических клубов, которые занимаются исследованием и обучением. Все они образуют одно из наиболее активных спелеологических сообществ в Греции.