После освобождения Крита от арабов Никифором Фокой в 961 году н. э. начался период возрождения, о котором свидетельствуют многочисленные памятники и который продолжался и после прихода венецианцев.
Именно тогда было основано большинство ныне действующих малых и крупных монастырей. Они выполняли не только религиозную функцию, но и сыграли важную роль в борьбе критян против захватчиков, особенно после завоевания Крита Османской империей.
Монастыри были единственным местом, где христиане могли найти убежище и подготовить военные операции. Заподозрив, что монахи поддерживают повстанцев, османы разрушили несколько монастырей, служивших крупными революционными центрами.
Даже сегодня посетителей поражает рассказ о геноциде в монастыре Аркади в 1866 году. Осажденные христиане решили взорвать бочки с порохом, чтобы не сдаваться в плен османам. Похожие истории о событиях тех времен можно услышать во многих монастырях.
Монастырь Св. Анастасии римской 
Монастырь Св. Анастасии римской – первый монастырь посвященный ей в Греции был основан в 2008 и открылся в июле 2009. Кроме главной церкви Св. Анастасии здесь также находится часовня Св. Космаса аэтолийского.
Неизвестно когда точно был основан монастырь, находится рядом с городом Рефимно в районе Кумпе (от этого района происходит название монастыря), на растоянии 200 м от Национальной Трассы.
Монастырь Святого Креста Восакос располагается у подножия невысокого холма, покрытого деревьями. Название происходит из дорийского диалекта и означает «место содержания коров». Возможно, говорит о роде занятия местных жителей.
Монастырь уже существовал в 1673 г. это видно из письменного указания, что ктитором монастыря является иеромонах Иеримия с подписью и этой датой. Находится в 47 км от Рефимно, рядом с деревнями Агридия и Крионери в районе Аногион.
Небольшой монастырь Дискуриу, который можно посетить по дороге в Зоньяна. Согласно имеющимся документам построен во времена правления византийского императора Константина на месте античного храма Диоскури. Во время турецкого ига был центром местного сопротивления и в 1821 году сильно разрушен турками.
Он лежит на холме, откуда открывается панорама на бухту и прибрежную деревушку Бали, которая находится в 37 км от Ретимно. Его также называют монастырь Аталис - так венецианцы назвали прибрежную деревню, изменив название древнего города Асталиса.
Монастырь Илии Пророка, в котором находится византийская церковь Илии Пророка, Святой Троицы и Агия-Зони (пояса Пресвятой Богородицы) - базилика с тремя нефами, цилиндрическим куполом, и колокольней с двумя колоколами, был основан в 1637 году. Монастырь стал центром восстания против турков, поэтому в 1821 году был разрушен.
Неизвестно когда был основан, находится в 5 кмот деревушки Акумиа в 40 км от города Рефимно в южной части Крита. Когдато была только маленькая церковь в стиле базилики в честь святого Антония, около 1950 года монах Феодосиос пристроил несколько келий к храму и таким образом превратил храм в монастырь. Пресольный день 17 января.
