Die Existenz zahlreicher Höhlen ist untrennbar mit der schroffen Topographie von Kreta verbunden. Die Menschen lebten in Höhlen vor Tausenden von Jahren, wie durch die prähistorischen Schnitzereien in der Höhle Skordilakia von Asfendou belegt wurde. Darüber hinaus wird die heutige religiöse Tradition in den Höhlen die kavernöse Kapellen beherbergt, eine Evolution der Anbetung der alten Götter in Höhlen.
Mougri Höhle 
Die Mougri Höhle befindet sich in der Mitte der Kouloukonas Berge, nordwestlich von Vossakos Kloster. Sie wurde in den Plattenkalk Felsen gebildet, wahrscheinlich entlang eines der großen Brüche in der Gegend.
Die Höhle Koumarospilios liegt in der Nähe des Klosters Gouverneto und hat einen großen archäologischen Wert. Die Höhle wurde 1942 von U. Jantzen und 1972 von I. Tzedakis ausgegraben.
Die Höhle liegt nordöstlich des Dorfes Nithavris auf einer Höhe von 700m. An Position Kalikas. Ihre Abmessungen sind 100m x 40m und haben eine maximale Höhe von 20 Metern. Abgesehen von ihren vielen Namen (Onymahos, Kallika Trypa, Notiki Tripa Nithavris, Paul Faure Cave), dem beeindruckenden Eingang mit der Inschrift mit dem alten Namen ONYMAXOC, beherbergt sie schöne Stalaktiten und verbirgt eine reiche Geschichte, die bezeugt, dass sie seit den antiken Zeiten bewohnt wurde.
Die Höhle Chonos Sitanos ist eine Höhle in der Nähe von Sitanos, wo es viele Höhlen gibt. Die Gesamtlänge der Strecken in der Höhle beträgt 400m und die maximale Tiefe beträgt 94m.
Im Süden von Kroustas treffen wir das historische Höhlen Totho Tafos (Grab), wo die Rebellen der EAM (griechische Guerilla Armee während des Zweiten Weltkrieges) während der deutschen Besatzung Schutz fanden. Wie üblich wurde der Ort durch Verrat offenbart, und die Deutschen verhafteten sie und führten alle an dieser Stelle aus..
Doxa Höhle liegt auf einer Höhe von 463m, in der Position Kaka Pila von Marathos, 20km westlich von Heraklion. Das ist eine kleine, aber bekannte Höhle, die ein sehr beeindruckendes Dekor in verschiedenen Farben und Formen hat. Doxa Höhle befindet sich 7,5 km nach der Kreuzung nach Tylisos, in Richtung Damasta.
Höhle Lavyrinthaki liegt 50 km südlich von Heraklion, auf einem kleinen Hügel zwischen Plouti und Moroni. Das ist ein kleiner alter Steinbruch mit einem ca. großen Raum von 300 qm, während die Höhe 4 m erreicht. Es gibt mehrere Säulen für die Unterstützung des Daches.
Atziganospilios liegt in kurzer Entfernung (10 'zu Fuß) vom Dorf Adrianos, im Ort Koukistres. Sie ist etwa 25 km südwestlich von Agios Nikolaos, bevor sie die Schlucht von Adrianos betritt.
