Die Existenz zahlreicher Höhlen ist untrennbar mit der schroffen Topographie von Kreta verbunden. Die Menschen lebten in Höhlen vor Tausenden von Jahren, wie durch die prähistorischen Schnitzereien in der Höhle Skordilakia von Asfendou belegt wurde. Darüber hinaus wird die heutige religiöse Tradition in den Höhlen die kavernöse Kapellen beherbergt, eine Evolution der Anbetung der alten Götter in Höhlen.
Hamoto Spiliari Höhle 
Wenige Meter südlich des Eingangs der Höhle Chainospilios treffen wir die Höhle Hamoto Spiliari (d. h. Tiefdachhöhle), die eine Länge von 32 Metern, eine maximale Breite von 6 Metern und eine Höhe von 6 Metern hat. Das ist eine sehr kleine Höhle, aber sie hat ihren Charme und verdient, erkundet zu werden!
Die Höhle Kato Platyvolo liegt in der Nähe der Siedlung Katsidoni, Sitia. Hier sind Spuren der alten Wohnstätte.
Die Höhle ist nicht zugänglich. Um sie zu erreichen, braucht man ein Seil, weil es dort eine abrupte Herunterschicht von 2 Metern gibt. Das ist ein allmählicher Kluft mit einer Gesamttunnellänge von 430 Metern. Es gibt einen See im Inneren, über den französische Höhlenforscher sagen, die Spiliara erforscht haben, und man braucht spezielle Ausrüstung für die Exploration.
Die Höhle Tafkos Palmeti befindet sich auf dem Strouboulas Plateau und ihre Tiefe ist 44m. Der Name stammt von dem christlichen Rebellen Giannis Palmetis (1790-1834 hatte seine Zuflucht bei Strouboulas und beobachtete die Straße nach Rethimnon). Als er einen Aga sah, schoss er ihn, nahm er von ihm alles, was er hatte, und warf ihn in den Golf, der von dann die Tafkos von Palmetis genannt wurde, um jede Spur auszulöschen.
Der Abgrund Gourgouthakas ist der tiefste Abgrund Griechenlands und der zweite auf dem Balkan. Der Zugang ist fast unmöglich und kann nur von erfahrenen Besuchern erreicht werden. Der zweitgrößte Abgrund Griechenlands ist auch auf Kreta und gilt als Tafkoura. Er befindet sich auf dem Gelände "Atzines" der Weißen Berge (Chania) und östlich des Gipfels des Heiligen Geistes in Melidoni.
Löwen (Leon) Höhle wurde offiziell am 11. August 2008 von einem französisch-griechischer Mannschaft von Speläologen entdeckt, um die Weißen Berge von Chania (Gebiet Atzinolakos, in der Nähe von Melidoni von Fre Gemeinde) zu erkunden. Allerdings war ihre Existenz während einer französischen Mission des Katamaran Vereins vor 15 Jahren bekannt.
Die Höhle von Hosto Nero befindet sich in der Region Selia von Youchtas Berg in der Nähe der Straße, die zur Spitze von Afentis Christos führt. Sie liegt auf einer Höhe von etwa 720 Metern in der südlichen Spitze des heiligen Berges und um sie zu sehen, muss man durch ein schmales Loch eindringen. Diese Höhle hat 3 Räume und viele Korridore, die sie alle mit dem ersten Raum von 7 Metern Länge verbinden, die genug Licht wegen ihrer großen Öffnung hat. Tief in der Höhle gibt es kleine Stalagmiten und kleine Wasserbecken.
