С прибытием на Крит Иоанна Отшельника начало развиваться мощное направление аскетизма, которое сохраняется и по сей день. Сотни отшельников стали уединяться в отдаленных уголках острова и сформировали целые аскетические сообщества, которые позже превратились в процветающие монастыри.
Особым примером отшельничества служит католический монастырь на мысе Акротири, где монахи живут в пещерах и выполняют свое служение вдали от мирских удовольствий. Также важную роль сыграли религиозные общины на уединенных полуостровах Грамвуса и Родопу, где работало несколько небольших монастырей.
Важнейшим обиталищем отшельников стали естественным образом изолированные непроходимые горы Астерусия к югу от Ираклиона. В сотнях пещер между Агиос Никитас и мысом Литино до сих пор живут отшельники. Они практически не общаются друг с другом. Отшельники районов Агиофараго и Марцало собираются раз в год в пещере Гуменоспилиос, чтобы выяснить, кто пережил этот год.
На востоке Крита в северной провинции Мирабелло находится крупнейший район обитания аскетов, где возведены десятки небольших монастырских строений. Здесь отшельники строят крошечные монастыри, где обычно живут в одиночку.
Церковь Пресвятой Богородицы Врефотрофос ("Кормилица") находится в центре города Айос-Николаос рядом с морем. Восстановленный храм представляет собой однонефную сводчатую постройку, с входом с западной стороны. Свод опирается на подпружные арки и покрыт двухскатной крышей. В период венецианского господства внутренние стены были расписаны фресками, которые сохранились лишь частично.
Церковь Св. Петра около Врахаси был храмом при маленьком монастыре, который работал здесь в XVII веке, на месте предшествующего храма XIV века. Мы можем разобрать следы стен и водяную мельницу (в районе очень много воды, а потому здесь очень много зелени).
Церковь расположена в деревни Меронас и самое раннее упоминание о ней находится в нотариальном документе 1301г. Поселок был назван Меронас, от греческого глагола «мероно» (расслабляться, остывать), так как согласно поверью, в этом месте Дева Мария (Панагея) отдыхала, во время строительства здесь храма.
Церковь Панагеи (Нашей Госпожи) Петраяды или Петрадии был храмом при маленьком монастыре, открытым здесь в XVI веке, возможно под покровительством монастыря Асомати. Единственный уцелевший элемент монастыря находится над входом с надписью даты 1843 и именем монаха Иосифа, который был здесь аббатом в 1860.
Ниже от окрополи Смари, где, как пологают некоторые, находилась древния Ликтос, в месте где был источник воды, работал небольшой монастырь пророка Илии. Вид с этой точки на долины Смарьи неповторимы, большой интерес проявляют геологические формации вокруг монастыря. Священный храм находиться в источнике водоснабженич, который, очевидно был водным ресурсом для старого города и дал жизнь урожаю жителям в этом не гостеприимным каменистом месте.
На окраине города Ретимно в Триа Монастерья, сразу напротив входа на городское кладбище, с очень красивой роще находятся руины каменного здания с маленькой церковью на его крыше.
Здесь раньше находился приморский монастырь 318 Агии Патерес (318 Святых Отцов). Монастырь прекратил свою работу из-за участившихся пиратских налетов в раннюю венецианскую эпоху. Сохранилась только его часовня.
Панагиа Чаракиани празднует 15 августа и особенно известна паломниками, которые собираються каждый год за 15 дней до фестиваля в хижинах около церкви, сделанных из тростников. Церковь принадлежит монастырю Иоанна Крестителя, где сохраненa чудотворная икона Панагиа (Дева Мария ). Икона была найдена пастухом, в небольшой пещере charaki, в горах к югу от церкви.