С прибытием на Крит Иоанна Отшельника начало развиваться мощное направление аскетизма, которое сохраняется и по сей день. Сотни отшельников стали уединяться в отдаленных уголках острова и сформировали целые аскетические сообщества, которые позже превратились в процветающие монастыри.
Особым примером отшельничества служит католический монастырь на мысе Акротири, где монахи живут в пещерах и выполняют свое служение вдали от мирских удовольствий. Также важную роль сыграли религиозные общины на уединенных полуостровах Грамвуса и Родопу, где работало несколько небольших монастырей.
Важнейшим обиталищем отшельников стали естественным образом изолированные непроходимые горы Астерусия к югу от Ираклиона. В сотнях пещер между Агиос Никитас и мысом Литино до сих пор живут отшельники. Они практически не общаются друг с другом. Отшельники районов Агиофараго и Марцало собираются раз в год в пещере Гуменоспилиос, чтобы выяснить, кто пережил этот год.
На востоке Крита в северной провинции Мирабелло находится крупнейший район обитания аскетов, где возведены десятки небольших монастырских строений. Здесь отшельники строят крошечные монастыри, где обычно живут в одиночку.
Панагия Мартсалиани 
Вначале маршрута вы увидите красивую церковь Панагии Мартсалианис, посвященную Благовещению Теотику. Церковь, построенная в скале, была использована в качестве катакомбы во время христианских гонений. Всего несколько веков была найдена случайно одним пастухом, закрытая камнями.
Замечательное месторасположение Химефту около деревни Мони приютило живописную церковь посвященную Св. Георгию и Священному Кресту. На этом месте находился монастырь Священного Креста, который был под покровительством монастыря Кавалларас в Корфесе.
Теперь заброшенный монастырь Св. Саввы находится неблагополучном районе Ираклиона (рядом с цементным и нефтеперерабатывающим заводами в Эллиноперамате). Монастырь был основан в X веке Никифорусом Форасом и, кажется, он был оставлен после набегом с моря.
Между деревнями Эпископи и Сгурокефали провинции Педьяда, мы видим красивый маленьких парк с сосновой рощей, посреди которого находится старый храм Господа Христа. Маленькая церковь с единственным нефом работала в качестве храма при маленьком монастыре, который был под покровительством монастыря Агаратос.
Этот трехнефный храм примечателен тем, что один из его нефов поперечный, а другие – вспомогательные. Раньше церковь была подворьем монастыря. Самой старой ее частью является южный неф, который датируется концом XII века или началом XIII.
Приблизительно в одном километре на юго-восток от деревни Скалани, провинции Ираклион, у Апосами сохранился доныне средневековый монастырь Св. Мины.
Этот однонефный сводчатый храм когдато служил кафоликоном монастыря, являвшегося подворьем большой святой обители Агарафос. В наше время сохранились только церковь и маленький колодец, в то время как монашеские кельи давно разрушились.
Церковь Св. Георгия Клидаса находится в красивейшем месте около деревни Каталагари и является примонастырским храмом, который работал здесь в венецианскую эпоху, возможно под покровительством более крупного монастыря. Название Клидас скорее всего происходит от фамилии основателя или владельца этой земли.
