Die Existenz zahlreicher Höhlen ist untrennbar mit der schroffen Topographie von Kreta verbunden. Die Menschen lebten in Höhlen vor Tausenden von Jahren, wie durch die prähistorischen Schnitzereien in der Höhle Skordilakia von Asfendou belegt wurde. Darüber hinaus wird die heutige religiöse Tradition in den Höhlen die kavernöse Kapellen beherbergt, eine Evolution der Anbetung der alten Götter in Höhlen.
Sarhos Höhle 
Die Höhle Sarhos, Honos oder Nychteridospilios liegt westlich des Dorfes Sarhos, auf einer Höhe von 276m. Das ist eine der größten und bedeutendsten Höhlen der Insel Kreta, die vor allem von den Besuchern wegen ihrer Komplexität und großer Länge geliebt wird. Die Gesamtlänge in der Höhle überschreitet 1500m, während die Tiefe der Höhle erreicht 230m.
Die Quelle und die Höhle von Kormokopos liegen nordwestlich von Agios Ioannis, auf der Ostseite der Schlucht Eligia. Der Weg von Agios Ioannis benötigt ca. 1,5 Stunden. Er beginnt als ein schöner Spaziergang durch den Wald von alten Kiefern- und Zypressenbäumen und endet fast plötzlich in einer wilden und imposanten Landschaft.
Die Höhle Ahnistres liegt westlich des Küstenortes Milatos, auf einer Höhe von 70 Metern und hat zwei Eingänge, die ganz von dichter Vegetation bedeckt werden. Ein Eingang hat 4m Tiefe, während der Haupteingang, 1,5m breit, führt zu einem absteigenden Gang, 6m lang, endet bei einer Passage von 0,5x0,5m. Der erste Raum mit dem steilen Eingang hat auch eine kleine Öffnung, die zur Haupthöhle mit beeindruckenden Stalagmiten und Säulen führt, die den Raum in mehrere Teile teilen.
Theriospilios ist eine kleine Höhle in der Lage Chyloftes - Therio, nordwestlich von Kavoussi in einer Höhe von 50m, an einem steilen Hang über dem Meer. Die Besucher erreichen die Höhle von Kavoussi nach 40 Minuten.
Die Höhle Chainospilios befindet sich 200 Meter vom Dorf Kamaraki. Die Höhle heisst auch Marmarospilios, während viele Einheimische es "Labyrinth" nennen. Das ist eine lange enge Höhle mit Galerien, die ein Teil des alten unterirdischen Flussbettes sind. Die Höhle ist in den meisten Teilen noch aktiv.
Tafkoura Höhle befindet sich in Petradolakia auf einer Höhe von 1480 Metern, ca. 13 km südlich von Anogia. Sie wird als Höhle eingestuft und ihre erforschte Tiefe beträgt 860m und die Gesamtlänge beträgt 6570 Meter. Sie gilt als die größte und tiefste Höhle des Psiloritis Berges und die 3. in Griechenland.
Die Höhle von Arkalochori, auch bekannt als Heilige Höhle, liegt an der Südwestseite des Dorfes Arkalochori, speziell im Südwesten der Profitis Ilias Kirche, 400m über dem Meeresspiegel. Ein schmaler Eingang (0.70cm breit, 1.60cm hoch) führt zum Innenraum, wo man wegen Platzmangels nicht aufrecht gehen kann.
Die Höhle Neraidogoula liegt auf einer Höhe von 1209 m, im Bett des Baches Linaras im Kiefernwald von Selakano. Die Identifizierung seines Eintritts ist ein wenig heikel, obwohl es einige Zeichen gibt, da sie sehr klein ist.
