Heraklion beherbergt viele Schluchten, von denen die meisten die Bereiche von Psiloritis und Asterousia kreuzen. Asterousia hat wunderbare Wanderschluchten, die wichtigsten sind Agiofarago, Martsalo und Trafoulas. Allerdings ist die berühmteste Schlucht Gafaris bei Psiloritis. Sie überquert das herrliche Eichenholz von Rouvas. Andere Schluchten von Psiloritis sind die Schlucht von Kroussonas, durch die der minoische Weg zur Idaeischen Höhle führt, die Schlucht Vromonero, die Schlucht Vorizano und die beiden kleinen Schluchten von Asites (Saint Charalambos und Saint Anthony). In der Nähe von Heraklion Stadt gibt es die üppigen Schluchten von Karteros, Kounavi, Sylamos, Almyros und Venerato. Die westlichen Hänge des Lassithi-Gebirges beherbergen die Schluchten von Roza, Ambelos, Apotyposi und den Fluss Aposelemis von Hersonissos.
Abgesehen von erreichbaren Schluchten, ist Heraklion die Heimat von einigen sehr beliebten technischen Schluchten wie die imposante Schlucht von Arvi, die nach einem 80m hohen Fall zu einem dunklen unterirdischen Fluss wird. Besonders das Gebiet von Tsoutsouras und Keratokambos ist die Heimat von vielen steilen Schluchten, die mit Schrauben und Anker ausgestattet wurden.
Mesosfini Schlucht 
Die wilde und unzugängliche Schlucht von Mesosfini liegt 55 km südlich der Stadt Heraklion, in einem abgelegenen Gebiet westlich des Badeortes Treis Ekklisies. Der Eingang befindet sich auf einer Höhe von 450m, in der Nähe der Dörfer von Mournies und Prinias, in den Asterousia Bergen. An ihrer Ausfahrt, 2 km südlich, bildet sie den majestätischen Strand von Voidomatis, der durch eine Schotterstraße von Tris Ekklisies zugänglich ist.
Anapodaris Schlucht wird am letzten Teil des längsten Flusses von Kreta, Anapodaris, gebildet, der das Wasser der zentralen Provinzen von Heraklion und Süddikti Strecke sammelt. Die vorgeschlagene Route hat eine Dauer von 3-3,5 Stunden und ist im Sommer oder im späten Frühling möglich, wenn der Fluss nicht zu viel Wasser hat. Es ist erwähnenswert, dass der Fluss zum Meer etwa 40 Millionen Kubikmeter Wasser jährlich führt.
Die Schlucht von Hl. Charalambos ist eine kleine, aber schöne Schlucht südlich des Dorfes Ano Asites. Sie hat ihren Namen nach der Kirche von Hl. Charalambos, die sich an ihrem Anfang befindet. Bis Mitte des Frühlings hat die Schlucht Wasser, was die Wanderer zwingt, sie zu durchqueren (entlang ihrer Mauern zu wandern).
Der Schlucht von Panagia (Jungfrau Maria), auch bekannt als Kalami I, ist parallel zur Schlucht Xerofarago oder Kalami II und hat ihren Namen nach dem ehemaligen Kloster von Panagia Keralimeniotissa genommen, das sich an ihrem Ausgang befindet.
Achendrias Schlucht liegt etwa 50 km südlich von Heraklion, ist ca. 8 km lang und endet am Strand Maridaki. Sie kreuzt die trockene Landschaft der Asterousia Range, die von nackten Bergen, scharfen Felsen und rauhen Weideflächen gekennzeichnet wird. Während der meisten ihrer Länge ist sie leicht zugänglich, abgesehen von dem letzten Teil, der nur von erfahrenen Besuchern der Schlucht zugänglich ist, da es ein 60m hoher Wasserfall gibt.
Xerofarago Schlucht liegt südlich von Kalami Dorf (Viannos Bereich), 75 km südöstlich von Heraklion. Das ist eine kleine Schlucht, ideal für den Besuch (bekannt als Kalami II), die in der Nähe der alten Kirche von Panagia Keralimeniotissa endet, wo eine weitere Schlucht, Kalami Schlucht, endet.
Die Schlucht Kakoperatos befindet sich 10 km südlich von Ahendrias Dorf, auf der östlichen Seite der Asterousia Berge. Sie beginnt ihre Route von der Lage Apomoni und endet am Strand von Skiadaki. Ihres Flussbett ist nur mit technischer Ausrüstung zugänglich, da sie 15m hohe Wasserfälle bildet. Alternativ kann man die schwierigen Passagen durch die Vermeidung der Stürze von den Seiten zu Fuss überwinden.
Die Schlucht von Gaidourorachi oder Kroussonas liegt 3 km westlich des Dorfes Kroussonas und überquert die Psiloritis Mt. Ausgehend vom alten Zominthos bei Anogia endet sie am Dorf Kitharida bei Kroussonas.
