После освобождения Крита от арабов Никифором Фокой в 961 году н. э. начался период возрождения, о котором свидетельствуют многочисленные памятники и который продолжался и после прихода венецианцев.
Именно тогда было основано большинство ныне действующих малых и крупных монастырей. Они выполняли не только религиозную функцию, но и сыграли важную роль в борьбе критян против захватчиков, особенно после завоевания Крита Османской империей.
Монастыри были единственным местом, где христиане могли найти убежище и подготовить военные операции. Заподозрив, что монахи поддерживают повстанцев, османы разрушили несколько монастырей, служивших крупными революционными центрами.
Даже сегодня посетителей поражает рассказ о геноциде в монастыре Аркади в 1866 году. Осажденные христиане решили взорвать бочки с порохом, чтобы не сдаваться в плен османам. Похожие истории о событиях тех времен можно услышать во многих монастырях.
Монастырь Эйясменос 
Монастырь Эйясменос («освященный») находится в 2км к северу от Иерапетры, поблизости с главной дорогой, соединяющей город с Пахия Аммос. Церковь монастыря посвящена Агии Пантес (Всем Святым) и в позднем XIX веке здесь находился дом епископа Иерапетры и Ситии.
С северо-западной стороны плоскогорья Лассити находится монастырь Видианис, от которого, видимо, образовалась фамилия семьи Видис (или Видидис), владеющей тогда этими землями. Строительство монастыря началось в 1841 г., скорее всего, на месте существовавшего ранее объекта религиозного характера.
Монастырь Крусталлениас посвящен Успению Богородицы. По информации, которая, однако, ни чем не подтверждается, монастырь был местом подготовки восстания против венецианцев в 1272 г. Если когда-то и существовал монастырь, то он, как и все, что находилось на плоскогорье Лассити, был разрушен после 1293 г.
Основан в 1985 году как паломничиский центр, в 2001 году присвоен статус монастыря. Находится в 10 км от Ираклиона по направлению в Ханью, слева от монастыря в деревне Родиа. Храм базилика с куполом, престольные дни 26 Февраля и 8 июля. Резеденция Критского Архиепископа, женский монастырь.
Основан в 1974 году, священиком Тимофеем Тзанис – ктитор монастыря. Находится в Ираклионе рядом с Университетской больницей, на высоте 100 м. Храм двух предельная базилика, освящен в честь св. Феодора и св. Маркелы. Престольный день 28 июня и 22 Июля.
Монастырь Хрисоваланду Критской архиепископии был открыт в 2002 г. и прославился своей благотворительной деятельностью: насельники монастыря обслуживают дом для престарелых.
Монастырь Святой Девы Марии Теогеннитор — монастырь Критской православной церкви, в 30 км от Ираклиона, в горной деревушке Мохос, находящейся рядом с небольшими курортными городками Малья и Сталида.
Монастырь Агия-Мони ("Святая обитель") находится на 60 км к востоку от Ираклиона и в 38 км на запад от Иерапетры, рядом с ущельем Кавусси. Добраться до него можно по короткому живописному пути из Ано Вианноса.
