С прибытием на Крит Иоанна Отшельника начало развиваться мощное направление аскетизма, которое сохраняется и по сей день. Сотни отшельников стали уединяться в отдаленных уголках острова и сформировали целые аскетические сообщества, которые позже превратились в процветающие монастыри.
Особым примером отшельничества служит католический монастырь на мысе Акротири, где монахи живут в пещерах и выполняют свое служение вдали от мирских удовольствий. Также важную роль сыграли религиозные общины на уединенных полуостровах Грамвуса и Родопу, где работало несколько небольших монастырей.
Важнейшим обиталищем отшельников стали естественным образом изолированные непроходимые горы Астерусия к югу от Ираклиона. В сотнях пещер между Агиос Никитас и мысом Литино до сих пор живут отшельники. Они практически не общаются друг с другом. Отшельники районов Агиофараго и Марцало собираются раз в год в пещере Гуменоспилиос, чтобы выяснить, кто пережил этот год.
На востоке Крита в северной провинции Мирабелло находится крупнейший район обитания аскетов, где возведены десятки небольших монастырских строений. Здесь отшельники строят крошечные монастыри, где обычно живут в одиночку.
Монастырь Калидена 
Над деревней Ано Мерос, на горе Кедрос, находится старый пустующий монастырь Калидена с восстановленным византийским храмом Господа Христа. Сегодня, кроме самой церкви, почти ничего от монастыря не осталось.
рядом с пляжем находятся руины бывшего монастыря, посвященного Святому Антонию, от которого сохранилась только часовня. Этот монастырь был покинут и заброшен из-за постоянных пиратских рейдов в венецианскую эпоху.
Церковь Агии параскевы в Кастеллос – это церковь с двумя проходами и каменным иконостасом. Это был храм при старом монастыре, заброшенном ныне. Монастырь был построен в красивом месте, поросшем высокими деревьями и очень подходящим для пеших прогулок.
Монастырь Андифонитрии в местечке Мириокефала в горной части Крита был основан в 1100 году монахом-пустынником Святым Иоанном. Сегодня в хорошей сохранности главный храм монастыря, крестово купольной архитектуры.
Он находится вблизи деревни Хромонастири в 12 км от Ретимно. Большая церковь с единственным нефом посвящена Святой Деве. На притолоке вырезан год - 1864. Однако, вероятнее всего, монастырь существовал еще в XVI-XVII веках. Все постройки, за исключением церкви, полуразрушены, а монастырь, разумеется, не действует. В 1991 году он был присоединен к монастырю Святой Ирины.
Мечеть Нерадзе в годы венецианского владычества была церковью Богородицы ордена монахов-августинцев. В 1657 году после захвата острова турками церковь была обращена в мечеть Гази Хусейн Нерадзес.
Монастырь Святого Петра и Павла находится в поселке Галлос около университета Крита. Отреставрированный монастырь, информации об истории которого почти не сохранилось, находится под покровительством монастыря Аркади.
Монастырь святого Георгия в Карили (провинция Апокоронас) расположен в 2 км к востоку от деревни Вамос. В течение многих лет монастырь был заброшен, но в 1996 году его отреставрировали, и сегодня он снова является действующим. Этот монастырь считается непревзойденным памятником народной архитектуры не только в провинции Апокоронас, но и во всей префектуре Ханья.
