Nach der Befreiung von Kreta durch Nicephorus Phocas von den Arabern im Jahre 961 n.Chr. folgte eine Zeit der kulturellen Renaissance, die sich durch die Denkmäler der Zeit widerspiegelt und die während der venezianischen Herrschaft fortgesetzt wurde.
Die meisten großen und kleinen Klöster, die heute operieren, wurden in dieser Zeit gegründet. Abgesehen von religiösen Bedürfnissen, spielten die meisten von ihnen eine wichtige Rolle bei den Kämpfen der Kreter für die Befreiung, vor allem nach der Eroberung von Kreta durch die Osmanen.
Die Kloster waren die einzigen Orte, an denen die Christen Schutz finden und ihre militärischen Operationen organisieren konnten. Verdächtig für die unterstützende Aktion der Mönche, zerstörten die Osmanen mehrere Klöster, die als revolutionäre Zentren fungierten.
Noch heute bewundern die Besucher die Geschichte des Holocaust des Arkadi-Klosters im Jahre 1866. Dann entschlossen sich die belagerten Christen, das Pulverfässer zu sprengen, um sich nicht den Osmanen zu ergeben. Alle Klöster dieser Zeit haben ähnliche Geschichten erzählt.
Halepa Kloster 
Das Kloster Christi, des Erlösers von Halepa, liegt auf einem hohen Hügel in der Nähe der Dörfer Tsahiana und Veni, 46 km östlich von Rethymno. Die Aussicht auf das Tal von Mylopotamos ist panoramisch. Vor 2000 war das Kloster eine Reihe von Ruinen, heute ist das restaurierte Kloster normal und ist eines der schönsten Klöster auf Kreta.
Das Kloster von Diskouri liegt 43 km östlich von Rethymnon und gilt als eines der ältesten Klöster auf Kreta. Sein Alter wird durch die nahe gelegene, reich verzierte byzantinische Kirche Hl. Johannes belegt. Der Komplex, der heute von dem Kloster von Halepa besessen wird, wird vermutlich über einem alten Tempel von Dioscuri gebaut, aber das ist nicht bewiesen.
Das Kloster Attali oder Bai liegt über dem Hügel von Agia Ypakoi, westlich von Bali, mit Panoramablick auf das Meer und in der Nähe der Hauptstraße, die Rethymnon mit Heraklion verbindet. Die Region wurde bis 1970 isoliert, als die Autobahn gebaut wurde, und so kamen Mönchtum und Askese bis dahin.
Das Kloster des Propheten Elijah (Profitis Elias) liegt oberhalb eines Hügels mit Panoramablick, 20 km südlich von Rethymno, neben dem Dorf Roustika. Das ist ein relativ unbekanntes Kloster auf Kreta, obwohl es im venezianischen Zeitalter gegründet wurde und zu den historischen Klöstern der Insel gehört.
Das Heilige Kloster Hl. Anthony liegt an der Stelle Katevati, 6 km vom Dorf Akoumia, auf einer Höhe von 525 m. Um das Kloster zu erreichen, müssen Sie 15 Minuten mit dem Auto auf einer unbefestigten Straße von Akoumia fahren.
Das Kloster des Agio Pnevma (Heiliger Geist) wurde wahrscheinlich im 12. Jahrhundert gegründet und sicherlich am Ende der venezianischen Herrschaft war es bereits autonom und im Wohlergehen. Am 15. Juni 1821 massierten die örtlichen Türken die Mönche und verbrannten das Kloster.
Auf dem Hügel des Bischofs (Sitz der Diözese) von Lambi, Sivritos und Sfakia, am Anfang der 1990er Jahre, wurde das Kloster des Heiligen Raphael gebaut. Der Haupttempel wird den Märtyrern Hl. Raphael, Nikolaos und Irini gewidmet. Das Kloster beherbergt auch die Kapellen von Hl. Irinaeus, Johannes des Täufers, Johannes des Einsiedlers und des Erzengels Michael.
