Многочисленные пещеры обязаны своим существованием изрезанному рельефу острова. Первобытные рисунки в пещере Скордилакия возле Асфенду свидетельствуют о том, что люди здесь жили уже тысячи лет назад. Более того, современная религиозная традиция устраивать в пещерах часовни имеет древние языческие корни.
Когда-то давно именно в пещерах минойцы поклонялись своим главным божествам, таким как Илифия, богиня-родовспомогательница. Позже они стали поклоняться царю богов Зевсу в Диктейской и Идейской пещерах, превратив их в важные религиозные центры. В Византийскую эпоху пещеры, в которых, как гласит предание, жили святые (например, Святой Павел, Герасим и Иоанн Ксифилин), были преобразованы в важные аскетические общины. Многие страницы истории Крита были написаны в его пещерах, например, в Мелидони, Милатосе, Крионериде и Тигани возле Грамвусы произошли кровавые побоища.
Ряд пещер имеет большое спелеологические и экологическое значение. Диктейская пещера в окрестностях Психро, Геронтоспилиос возле Мелидони и Сфендони близ Зонианы славятся своим богатым убранством и открыты для посетителей. Помимо пещер, имеющих религиозную или историческую ценность, на карте острова отмечено свыше 4500 пещер и карстовых воронок, насладиться прекрасным убранством которых может любой опытный спелеолог. Территории, богатые интереснейшими пещерами, — это гора Струмбулас у Ираклиона, геопарки Сития и Псилоритис, а также район Мелидони в Белых горах. Три глубочайшие карстовые воронки Греции расположены на Крите.Пещеры
Пещера Сфендони 
Зоньяна находится в 43 км от Ираклиона и 52 км от Ретимно. На въезде в деревню есть пещера Сфендони или Сфендони-дыра. Имеется в виду одна из самых красивых пещер Греции богатой сталактитами и сталагмитами. Пещера занимает площадь в 3000м и является одной из самых зрелищных в Греции. В 270 метрах от тропы, посетители могут насладиться природой, которая с большим терпением создает из капелек воды и солей, прекрасное зрелище.
Диктейская пещера или Пещера Психро — пещера расположенная в Диктийских горах над плато Ласити, остров Крит, Греция. Расположена на высоте 1024 метров над уровнем моря. Является одной из популярных достопримечательностей Крита. В рекламных целях её часто называют Пещерой Зевса.
Пещера Милатос, известная также под названием пещера Рапас, расположена в 3 км от Милатоса. Пещера Милатос широко известна в связи с трагедией,происшедшей здесь в феврале 1823 года. Зимой 1823 года турецкий наместник Хасан-Паша разрушал и опустошал греческие поселки на плато Лассити. Затем его войска двинулись в район Мирабелло.
Пещера Скотино также известна как пещера Агия Параскеви находится в Ираклионе, на Крите. Пещера Агия Параскеви расположена на высоте 225 м, недалеко от деревни Скотино, приблизительно в 22 км от города Ираклиона. Она одна из трех самых больших пещер Ираклиона. Висота пещеры 10 метров а ширина 27 метров.
Пещера Мелидони находится в 1,8 км к северо-западу от деревни Мелидони и представляет особый интерес своими археологическими находками, некоторые из которых выставлены в Археологическом музее города Ретимно. Это место было местом поклонения Гермесу, Зевсу и Талосу.
Катсоматадо известна расположенной на высоте 400 метров над уровнем моря пещерой, пещерой Премудрости Божьей , часто также именуемой пещерой Святой Софии. Пещера известна историями и легендами из различных эпох истории острова. Здесь была найдена икона Премудрости Божьей вывезенная критскими солдатами из церкви, построенной Императором Юстинианом в Константинополе. Икона была вывезена отступающими критскими войсками (около 1500 человек) во время захвата Константинополя турками.
В окрестностях селения Патсос находится пещера Святого Антония, покровителя детей. Расположено это место на дне небольшого ущелья, по которому протекает маленькая речушка, вернее, ручей. Кругом растут деревья, поэтому там в жару - свежо и прохладно. Есть там и святой источник.
Между деревней Курнас и озером есть очень красивая пещера, пещера Курнас. Хотя она относительно небольшая, глубиной в около 35 метров, но впечатляет красотой внутреннего убранства. Если вы посетите ее в послеобеденные часы, то увидите как в полумраке пещеры редкие солнечные лучи преламляются в великолепных сталактитах и сталагмитах, создавая неимоверно красивую игру света.
