С прибытием на Крит Иоанна Отшельника начало развиваться мощное направление аскетизма, которое сохраняется и по сей день. Сотни отшельников стали уединяться в отдаленных уголках острова и сформировали целые аскетические сообщества, которые позже превратились в процветающие монастыри.
Особым примером отшельничества служит католический монастырь на мысе Акротири, где монахи живут в пещерах и выполняют свое служение вдали от мирских удовольствий. Также важную роль сыграли религиозные общины на уединенных полуостровах Грамвуса и Родопу, где работало несколько небольших монастырей.
Важнейшим обиталищем отшельников стали естественным образом изолированные непроходимые горы Астерусия к югу от Ираклиона. В сотнях пещер между Агиос Никитас и мысом Литино до сих пор живут отшельники. Они практически не общаются друг с другом. Отшельники районов Агиофараго и Марцало собираются раз в год в пещере Гуменоспилиос, чтобы выяснить, кто пережил этот год.
На востоке Крита в северной провинции Мирабелло находится крупнейший район обитания аскетов, где возведены десятки небольших монастырских строений. Здесь отшельники строят крошечные монастыри, где обычно живут в одиночку.
Монастырь Св. Иоанна Богослова, Аптера 
Восстановленный Византийский Монастырь Святого Иоанна Богослова находится рядом с огромными римскими водохранилищами древнего города Аптеры. Считается, что он был построен в 7 веке н.э. как часть монастыря острова Патмос, каким он и оставался до 1964 года, когда он был внезапно оставлен.
В окрестностях района Вамос, со стороны венецианской деревни Кариди Картсомадо и поблизости с монастырем Св. Георгия в Кариди, мы встречаем руины маленького заброшенного монастыря Панагеи в Катомери.
За пределами деревни Геракари, в 41 километре от Ретимно, находится церковь Святого Иоанна Богослова, возраст церкви датируется 13 веком. Эта трёхнефная церковь имеет черепичную крышу, куполообразный притвор (пристройка перед входом в храм) был достроен позже. Храм украшен чрезвычайно интересными фресками.
Основан монастырь в 1642 году, находится в районе Амарио неподалеку от деревень Монастираки и Вистаги, в 35 км от города Рефимно. Монастырь построен в последнии годы Веницианского владычества. В 1821 года монастырь был разрушен турками, в 1833 году востановлен иеромонахом Иосифом.
Об этом небольшом монастыре, являющемся подворьем монастыря Пресвятой Богородицы Фанероменис, не было известно никаких исторических или архивных данных до конца XIX в. В монастырском комплексе, который в прошлом веке использовался жителями Мифи как место летнего пребывания.
Монастырь Панагия Армос находится в Армос в 5 км юго-восточнее деревни Маллес, в непосредственной близости от монастыря в Exakousti, и имеет панорамный вид на сосновый лес Selakano.
О монастыре Пресвятой Богородицы Вриоменис сохранилось немного исторических данных, несмотря на то, что он был основан в поствизантийский период. Впечатляющий монастырский комплекс с середины XIX в. до 1990-х годов оставался заброшенным.
Монастырь Панагеи Паплину находится в 10км к востоку от Иерапетры, около района Катарадес и относительно близко к морю (в 2км). Монастырь сегодня не заселен, но в здешней церкви пышно отмечают 15 августа.
