С прибытием на Крит Иоанна Отшельника начало развиваться мощное направление аскетизма, которое сохраняется и по сей день. Сотни отшельников стали уединяться в отдаленных уголках острова и сформировали целые аскетические сообщества, которые позже превратились в процветающие монастыри.
Особым примером отшельничества служит католический монастырь на мысе Акротири, где монахи живут в пещерах и выполняют свое служение вдали от мирских удовольствий. Также важную роль сыграли религиозные общины на уединенных полуостровах Грамвуса и Родопу, где работало несколько небольших монастырей.
Важнейшим обиталищем отшельников стали естественным образом изолированные непроходимые горы Астерусия к югу от Ираклиона. В сотнях пещер между Агиос Никитас и мысом Литино до сих пор живут отшельники. Они практически не общаются друг с другом. Отшельники районов Агиофараго и Марцало собираются раз в год в пещере Гуменоспилиос, чтобы выяснить, кто пережил этот год.
На востоке Крита в северной провинции Мирабелло находится крупнейший район обитания аскетов, где возведены десятки небольших монастырских строений. Здесь отшельники строят крошечные монастыри, где обычно живут в одиночку.
Монастырь Агиос Элефтериос, Мурнис 
Разрушенный монастырь Агиос Элефтериос в Мурнисе находится под протекторатом монастыря Хрисопиги и расположен возле главного госпиталя Ханьи, посреди оливковой рощи, рядом с домами и школой. Здесь был крещен самый важный греческий политик современности Элефтериос Венизелос.
Разрушенный монастырь Св. Георгия Мормориса находится в деревне Нерокуру около Ханьи и датируется 1637 (и ранее). Монастырь, в свое время обладавший огромным состоянием является «подшефным» монастырю Гувернето и был объявлен охраняемым памятником.
В одном из самых удаленных уголков Крита, на полуострове Грамвуса, работал маленький монастырь Св. Иоанна, посвященный Усекновению главы Иоанна Предтечи.
Покинутый монастырь Гра Кера в Делиане посвящен рождению Девы Марии (Панагеи). Имя происходит от Иера Кера, т.е., Святая Госпожа. В 1632 монастырь попал под покровительство более крупного монастыря Гония Одигитрия в Колимбари, который уже был открыт к тому времени.
Здесь в лесистой местности находился монастырь, посвященный Священному Кресту. Сегодня монастырь не работает.
Маленький монастырь Явления Господня работал в Хампата (провинция Киссамос), с захватывающими видами окрестностей. Главное празднество храма происходит 2 февраля.
Когда Средиземноморье страдало от пиратских рейдов, монахи приморского монастыря Святого Георгия в Менисе решили перебраться в более безопасное место. Так они выбрали место, в котором сегодня мы находим живописную церковь при кладбище монастыря Гония Одигитриас, посвященную Св. Георгия (XIV века).
Монастырь Святого Павла с его великолепными настенными фресками, полными вмятин от пиратов, собирателей морских губок и венецианских “гостей”, находится недалеко от пляжа и пользуется особенной любовью жителей Крита.
