Многочисленные каньоны Ираклиона прорезают горные хребты Псилоритис и Астерусия. Основные каньоны Астерусии, которые облюбовали любители активного отдыха — Агиофараго, Мартсало и Трафулас. Однако самым знаменитым ущельем является каньон Гафарис в горах Псилоритис, простирающийся через великолепную дубраву Рувас. Ущелье Крусонас, через которое проходит минойская тропа к Идейской пещере, ущелья Вромонеро и Воризано, и два небольших каньона — Святого Хараламбоса и Святого Антония в Аситесе — все они также находятся в горах Псилоритис. Возле города Ираклион расположены зеленые каньоны Картерос, Кунави, Силамос, Альмирос и Венерато. На западных склонах гор Лассити находятся каньоны Роза, Амбелос и Апотипоси, а также река Апоселемис неподалеку от Херсониссоса.
Ущелье Ахендриас находится приблизительно в 52км к югу от Ираклиона и является приблизительно , 8км в длину и заканчивается на пляже Маридаки. Оно расположено посреди засушливого ландшафта кряжа Астерусия, отличительными элементами которого являются голые горы, острые камни и обширные пастбища вокруг. Почти по всей длине ущелья сюда можно попасть без проблем. Здесь сухо летом.
Ущелье Святого Хараламбоса – маленький, но красивый каньон к югу от деревни Ано Аситес и получило свое имя от церкви Святого Хараламбоса, размещенной вначале ущелья. До середины весны в ущелье есть вода, что вынуждает путешественников искать окольные пути (двигаться около стен).
Ущелье Порофараго или Сфакориако – это маленький каньон, почти 2км длиной, начинающийся у деревни Като Ватия и заканчивающийся у поселка Врахокипос. Ущелье пересекает река Кроммидас, несущая свои воды к пляжу Кокини Хани.
Ущелье Этии или Ворно находится к югу от Ираклиона у кряжа Астерусия. Оно начинается у деревни Этия и, направляясь по Астерусии на север, и заканчивается у равнины Мессара, между деревнями Ротаси и Месохори.
Ущелье Портела находится на юге префектуры Ираклиона; каньон начинается у деревни Хондрос и заканчивается у Кератокамбос. Это один из самых опасных каньонов Греции. В особенности после ливня, посещение ущелья может обернуться несчастьем. Хотя у ущелья пролегает пешеходная тропинка, которая идет из Хондроса в Кератокамбос.
Одним из наиболее впечатляющих и длинных каньонов всего острова Крит – каньон с какофоническим названием Псорарис (с греческого «тот, кто страдает от чесотки»). Выход из ущелья находится в горах Дикти, над деревней Гераки и начинается на плато Парасирта. Здесь есть три разных горных дороги, все уникально красивые: с плато Лассити (деревня Каминаки), из Гераки и Катофиги у Вияннос.
Ущелье Псаро Неро находится в 55км на юго-восток от Ираклиона. Это короткий неприступный каньон с высокими водопадами (раппелями) и хорошо известный скалолазам Крита.
Ущелье Гэйдурорахи или Круссонас находится в 3км к западу от деревни Круссонас и пересекает гору Псилоритис. Начиная у древнего Зоминтоса у Аногии и заканчивается у деревни Китарида у Круссонаса.