Ακριβώς απέναντι από το λιμάνι του Αγίου Νικολάου βρίσκεται η νησίδα Άγιοι Πάντες, η οποία παίρνει το όνομά της από το ομώνυμο εκκλησάκι. Κατά την εορτή του ναού (56 μέρες μετά το Πάσχα) δεκάδες κάτοικοι της πόλης περνούν στο νησί με τα καραβάκια για να πάρουν μέρος στην δοξολογία. Δίπλα στο ναό των Αγίων Πάντων υπάρχει θολωτό κτίσμα που ανάγεται στην εποχή της Ενετοκρατίας
Στο νησί υπάρχουν διάσπαρτα πολεμικά κτίσματα από τον Β' Παγκόσμιο Πόλεμο, όταν το νομό Λασιθίου κατείχαν οι Ιταλοί. Υπάρχουν πολλές στρογγυλές βάσεις για τα κανόνια των Ιταλών, ενώ σε αρκετά σημεία συναντάμε οχυρωματικά έργα. Στην ανατολική πλευρά υπάρχει κι ένα παρατηρητήριο.
Το νησί, μαζί με διπλανό Μικρονήσι, αποτελούν φυσικούς κυματοθραύστες που προστατεύουν τον Άγιο Νικόλαο από τον έντονο κυματισμό. Επίσης στο νησάκι έχει μεταφερθεί υβρίδια αγριμιών (Κρητικών αιγαγρων) για την προστασία τους. Περίπου στο κέντρο του νησιού υπάρχει μια μοναδική μικροσκοπική παραλία με άμμο.
Ευχαριστούμε θερμά το Λεωνίδα Κλώντζα για τις πληροφορίες και τις φωτογραφίες
Νησίδα Μικρονήσι ή Φανάρι 
Παραλία Άγιοι Πάντες 
Η νησίδα Άγιοι Πάντες του Αγίου Νικολάου φιλοξενεί μια πανέμορφη μικροσκοπική παραλία με άμμο και καταγάλανα νερά κοντά στο σημείο όπου δένουν οι βάρκες που μεταφέρουν τους προσκυνητές του ναού των Αγίων Πάντων.
