Ο ναός του Αγίου Νικήτα (13ος αιώνας), που ΄πιθανόν λειτούργησε κι ως μοναστήρι, βρίσκεται περίπου 300μ. βορειοανατολικά του Φραγκοκάστελου, πάνω στα ερείπια τρίκλιτης παλαιοχριστιανικής βασιλικής του 6ου αιώνα. Η βασιλική ήταν τρίκλιτη με νάρθηκα και είχε διαστάσεις 26μ x 9μ. Το ιερό βήμα καταλαμβάνει το ανατολικό τμήμα του μεσαίου κλίτους κι επικοινωνούσε με τα άλλα κλίτη μέσα από μικρά ορθογώνια παστοφόρια, από τα οποία σώζεται μόνο το βόρειο.
Ο σημερινός ναός έχει κτιστεί στο σημείο που ήταν πριν το ιερό βήμα με υλικά από τα ερείπια της βασιλικής. Ακόμα διακρίνονται δυο εντοιχισμένοι κίονες στην τοιχοποιία του. Στο εσωτερικό του φέρει ίχνη τοιχογραφιών σε κακή κατάσταση που χρονολογούνται στον 13ο αιώνα. Γύρω από το ναό σώζονται ερείπια κτισμάτων, μέλη του οποίου χρησιμοποιήθηκαν για την κατασκευή του Φραγκοκάστελου.
Στην αυλή της σημερινής εκκλησίας μέχρι πριν μερικά χρόνια υπήρχαν δείγματα των τοίχων και του ψηφιδωτού δαπέδου της βασιλικής, πολλά από τα οποία έχουν μεταφερθεί σε μουσείο. Σώζονται διάφορα γεωμετρικά σχήματα (ρόμβοι, μαίανδροι, κύκλοι και ημικύκλια, τετράγωνα σε κύκλο, κα), αλλά και ιδιαίτερες φυτικές και ζωικές παραστάσεις. Ανάμεσα στα σχέδια διακρίνεται μια πάπια, ενώ στο βόρειο κλίτος απεικονίζεται μαύρος τράγος μέσα σε βλαστούς.
Φωτογραφίες: Ιάκωβος Δασκαλάκης