Οι Τρεις Εκκλησιές είναι μικρός παραθαλάσσιος οικισμός που βρίσκεται 64 χλμ νότια του Ηρακλείου, στην καρδιά του άγριου και αφιλόξενου τοπίου των Αστερουσίων. Από τότε που ασφαλτοστρώθηκε ο δρόμος με τις πολλές φουρκέτες που οδηγεί εδώ από το χωριό Παράνυμφοι ο οικισμός αποτελεί την πιο γρήγορη εξόρμηση στη νότια ακτογραμμή της Κρήτης από το Ηράκλειο.
Η ευρύτερη περιοχή είναι μια από τις πλέον απομονωμένες της Κρήτης και διαθέτει μερικές από τις πιο όμορφες παραλίες του νησιού, πολλές από τις οποίες είναι προσβάσιμες μόνο με σκάφος. Ωστόσο, οι περισσότεροι επισκέπτες κολυμπούν στην κεντρική παραλία του οικισμού, η οποία είναι αρκετά μεγάλη κι έχει χοντρή άμμο και βαθιά νερά. Η παραλία δεν είναι ιδιαίτερα οργανωμένη, αλλά τα τελευταία χρόνια υπάρχουν δωμάτια για ενοικίαση, καφενεία και ταβέρνες.
Η κεντρική παραλία ορίζεται στα δυτικά από τον μαύρο βράχο Μπουρούνι, όπου δένουν και οι βάρκες των κατοίκων και καταλήγει το ρέμα από το φαράγγι του Αμπά. Το Μπουρούνι από μακριά θυμίζει το πρόσωπο ανθρώπου, έχοντας δώσει τροφή σε διάφορους θρύλους σχετικά με τη δημιουργία του. Ένας από αυτούς θέλει να είναι η πετρωμένη γυναίκα ενός ναυτικού που τον περίμενε στο σημείο αυτό για χρόνια, αλλά αυτός είχε πνιγεί.
Στο μέσον περίπου της παραλίας και στα ανοιχτά υπάρχει η Πλακούρα, ένας ύφαλος που οι ντόπιοι αρέσκονται να κολυμπούν και να στέκονται πάνω του.
Στα ανατολικά υπάρχει ο εντυπωσιακός ανοιχτόχρωμος βράχος του Κωλοβρέχτη. Το περίεργο αυτό όνομα οφείλεται σε παλιό τύπου ψαρέματος με δίχτυα κοντά στην ακτή, γνωστό κι ως γρίπος ή πεζότρατα. Από τον Κωλοβρέχτη ξεκινάει μια ακόμη μεγάλη παραλία που καταλήγει στο Βόλακα, ένα εντυπωσιακό βράχο που έχει σκιστεί στη μέση. Ο Κωλοβρέχτης δεν είναι οργανωμένος, έχει σκιά από μερικά αλμυρίκια και στα δυτικά του υπάρχουν πολλές πικροδάφνες που ποτίζονται από πηγή γλυκού νερού.