Το μοναστήρι της Παναγίας της Περαμπελιώτισσας, γνωστό στους εκκλησιαστικούς κύκλους ως Μονή Γενεθλίου της Θεοτόκου, βρίσκεται βόρεια από το χωριό Κουρούνες και νότια του Νοφαλιά κοντά στη Νεάπολη.
Σε απόσταση 250m από τη θάλασσα θα δείτε το ερειπωμένο μοναστήρι του Αγίου Αντωνίου, από το οποίο μόνο το εκκλησάκι σώζεται. Η μονή προφανώς εγκαταλείφθηκε λόγω των συχνών πειρατικών επιδρομών κατά τη διάρκεια της Ενετοκρατίας.
Η έρημη σήμερα μονή της Κοίμησης της Θεοτόκου στον Αστυρακιά, βρίσκεται σε μια ειδυλλιακή τοποθεσία στην ανατολική πλευρά του Αρκαδιώτικου Φαραγγιού. Από το μικρό αυτό μοναστήρι σώζεται ο ναός και ίχνη από τα κελιά, ενώ εντύπωση προκαλούν οι αναβαθμίδες που χρησιμοποιούνταν για να κρατούν το χώμα και να καλλιεργούν.
Το έρημο μοναστήρι του Τιμίου Προδρόμου (εορτ. 29 Αυγούστου) βρίσκεται στην περιοχή Σκουράς πάνω από την Ελούντα. Ο ναός είναι ανακαινισμένος μονόχωρος, καμαροσκέπαστος, μικρών διαστάσεων και δίπλα του υπάρχουν τα ερείπια από τα κελιά, δεξαμενή και ένα νεώτερο διώροφο κτίσμα του 19ου αιώνα με στάβλο στο ισόγειο. Η ίδρυση της μονής τοποθετείται πριν από το 1575, ενώ το 1617 έγινε μετόχι της μονής Αρετίου.
Σε μικρή απόσταση από τον οικισμό Καμάρι Μαλεβυζίου θα συναντήσουμε την πολύ παλιά αναπαλαιωμένη εκκλησία της Παναγίας, χτισμένη στην διάρκεια της Οθωμανικής περιόδου σε μια περιοχή κατάφυτη από αμπέλια.
Στο ανατολικότερο σημείο του έρημου σήμερα οικισμού Ρούμα συναντάμε το ναό της Ζωοδόχου Πηγής που σώζεται σε πολύ καλή κατάσταση και είναι πραγματικό στολίδι. Στο εσωτερικό του υπάρχει ενσωματωμένο στον τοίχο ένα από τα πιο επιβλητικά αρκοσόλια στην Κρήτη όπου μάλλον είναι θαμμένος ο κτήτορας του ναού.
Ο ναός της Παναγίας της Κρυονερίτισσας βρίσκεται σε υψόμετρο περίπου 1100μ στο όρος Κέδρος και υπάγεται στην ενορία των Βρυσών Αμαρίου. Παίρνει το όνομά της από κοντινή πηγή. Είναι μονόχωρος καμαροσκέπαστος ναός αφιερωμένος στη Ζωοδόχο Πηγή και φέρει εντυπωσιακές ανάγλυφες παραστάσεις στις πελεκημένες πέτρες της εισόδου.
Η μονή των Αγίων Αποστόλων βρίσκεται στη τοποθεσία που λειτουργεί σήμερα το οινοποιείο Στραταριδάκη. Το μοναστήρι, σήμερα ερειπωμένο, λειτούργησε ως μετόχι της μονής Σινά και κατά τη Γερμανική Κατοχή ανέπτυξε πλούσια αντιστασιακή δράση, κυρίως τροφοδοτώντας και υποστηρίζοντας την ομάδα ανταρτών του Μανώλη Μπαντουβά.