Το Κισσανό φαράγγι βρίσκεται περιπου 1χλμ βορειοδυτικά του χωριού Κισσός της επαρχίας Αγίου Βασιλείου και 34χλμ νοτιοανατολικά του Ρεθύμνου, ενώνοντας τον Κάμπο του Κισού με το οροπέδιο του Γιους Κάμπου. Ο ποταμός που ρέει μέσα σε αυτό αποτελεί τον κύριο τροφοδότη νερού του Φρατιανού Φαραγγιού. Το φαράγγι δεν έχει ψηλή βλάστηση στο εσωτερικό του και έχει μικρά ραπέλ (καταρρακτες) 5-7μ, όντας ιδανικό κυρίως για καταρρίχηση, παρόλο μπορεί κάποιος με προσοχή να παρακάμψει τους καταρράκτες από το πλάι χωρίς εξοπλισμό.
Η πορεία ξεκινάει από το μικρό οροπέδιο του Γιους Κάμπου, τον παράδεισο των βοτανολόγων, λόγω της εξαιρετικά ποικιλόμορφης χλωρίδας του. Μετά από 20 με 30 λεπτά περπάτημα μέσα στην κοίτη του ή παράλληλα σε αυτή στους καταρράκτες, φτάνετε στο σημείο όπου το ποτάμι διασχίζεται από τον επαρχιακό δρόμο που ενώνει τον Κισσό με το Γιους Κάμπο. Στο σημείο αυτό υψώνεται ένας επιβλητικός κοκκινωπός βράχος με πολλά σπηλιάρια που ονομάζεται Κόκκινος Δέτης («δέτης» ειναι ο γκρεμός στην Κρητική διάλεκτο) και γι’ αυτό οι ντόπιοι ονομάζουν το φαράγγι κι ως Φαράγγι του Κόκκινου Δέτη.
Στο σημείο αυτό ουσιαστικό τελειώνει το κυρίως τμήμα του φαραγγιού, αλλά το ποτάμι συνεχίζει την κατηφορική του πορεία σχηματίζοντας μικρούς καταρράκτες. Στη συνέχεια διέρχεται δίπλα στο τεχνητό πευκόδασος των Βατόλακκων, έκτασης περίπου 600 στρεμμάτων, πριν συνεχίσει την πορεία του προς το Σπήλι και στη συνέχεια προς το Φρατί.