Η κοιλάδα του Αμαρίου σχηματίζεται ανάμεσα στα όρη του Κέδρου και στον Ψηλορείτη, σε υψόμετρο 400μ-500μ και έχει μήκος 25χλμ. Είναι το φυσικό πέρασμα από το βόρειο Ρέθυμνο προς τον νότο και τη Μεσαρά. Γι’ αυτή την κεντρική του θέση, υπήρξε θέατρο ιστορικών μαχών, κυρίως κατά τη διάρκεια της Τουρκοκρατίας. Η κοιλάδα είναι στολισμένη με όμορφα χωριουδάκια, με το μεγαλύτερο να είναι ο Φουρφουράς.
Το Αμάρι ανήκει στις περιοχές της Κρήτης με τις μεγαλύτερες βροχοπτώσεις. Από εδώ πηγάζει ο Πλατύς ή Αμαριανός Ποταμός που εκβάλει στην Αγία Γαλήνη, αλλά και εδώ υπάρχει ένα από τα μεγαλύτερα φράγματα της Κρήτης, το φράγμα των Ποταμών. Παλιές Βυζαντινές εκκλησίες, μινωικοί οικισμοί και άγρια βουνά τριγύρω προκαλούν ένα όμορφο συναίσθημα σε όποιον επισκεφτεί το μέρος αυτό. Το φαράγγι της Πατσού, το Σπήλαιο του Αγίου Αντωνίου, η αρχαία Σίβρυτος, η μονή των Ασωμάτων, οι μινωικοί οικισμοί στο Μοναστηράκι και στο Αποδούλου είναι από τα πιο γνωστά αξιοθέατα του Αμαρίου.