Λόγω του μικρού της πλάτους της η Κρήτη έχει λίγα ποτάμια, που ξεκινούν από τους ορεινούς όγκους του νησιού στο κεντρικό του κομμάτι και καταλήγουν στο Νότιο Κρητικό Πέλαγος και το Βόρειο Κρητικό Πέλαγος. Τα περισσότερα από αυτά έχουν λιγοστό νερό μονάχα κατά τους χειμερινούς μήνες, ενώ το καλοκαίρι είναι τελείως ξηρά.
Ο Ποταμός Μορώνης (ή Πέρα) συγκεντρώνει τα νερά του από την ευρύτερη περιοχή της Σούδας και Βιοτεχνικού Πάρκου Χανίων και τα μεταφέρει στη παραλία της Σούδας. Το συνολικό του μήκος δεν ξεπερνάει τα 5χλμ, αλλά είναι σημαντικός καθώς έχει ροή όλο το χρόνο.
Ο Ληθαίος Ποταμός συγκεντρώνει τα νερά από την λεκάνη της Γέργερης και του Πανασού στις νοτιοανατολικές ρίζες του Ψηλορείτη. Συνεχίζει την πορεία του ως ανοιχτός ποταμός από τα Απομαρμά, κατά τη διάρκεια της οποίας πολλά κάθετα ρυάκια χύνονται στην κοίτη του.
Ο Τυφλός Ποταμός βρίσκεται στην επαρχία Κισάμου και το κύριο τμήμα του έχει μήκος περίπου 20 χλμ. Σύμφωνα με τους ντόπιους, η ονομασία του προέρχεται από το γεγονός ότι όταν φουσκώσει, δε «βλέπει» και παρασύρει οτιδήποτε βρεθεί μπροστά του. Το ρέμα έχει νερό ως τις αρχές του καλοκαιριού, ανάλογα πάντα με τις βροχοπτώσεις της χρονιάς.
Ο ποταμός Μουσέλας διαρρέει τις κοιλάδες που σχηματίζονται ανατολικά των Λευκών Ορέων και χύνεται στη μεγάλη παραλία της Επισκοπής, την παραλία με τα περισσότερα ποτάμια στην Κρήτη. Αποτελεί το φυσικό σύνορο των νομών Χανίων και Ρεθύμνου.