Λόγω του μικρού της πλάτους της η Κρήτη έχει λίγα ποτάμια, που ξεκινούν από τους ορεινούς όγκους του νησιού στο κεντρικό του κομμάτι και καταλήγουν στο Νότιο Κρητικό Πέλαγος και το Βόρειο Κρητικό Πέλαγος. Τα περισσότερα από αυτά έχουν λιγοστό νερό μονάχα κατά τους χειμερινούς μήνες, ενώ το καλοκαίρι είναι τελείως ξηρά.
Ποταμός Ταυρωνίτης 
Στα Δυτικά του νομού των Χανίων και 20 περίπου χιλιόμετρα από την πόλη των Χανίων συναντάμε τις εκβολές του ποταμού Ταυρωνίτη στο χωριό του Ταυρωνίτη, ο οποίος είναι γνωστός για την μεταλλική γέφυρα που αποτελεί μνημείο για την Μάχη της Κρήτης, όταν και βομβαρδίστηκε.
Ο Ακουμιανός ποταμός είναι ο τρίτος σε μέγεθος και ποσότητα νερου της επαρχίας Αγίου Βασιλείου Ρεθύμνου (μετά τον Μέγα Ποταμό και τον Πλατύ ποταμό). Παίρνει το νερό του από δεκάδες πηγές από τις πλαγιές των βουνών Κέδρος και Ασιδέρωτας και έχει ροή νερού όλους τους μήνες του χρόνου, ιδιαίτερα στο πάνω μέρος του.
Ο Γεροπόταμος Ρεθύμνου είναι μεγάλος ποταμός που εκβάλει στην παραλία του Γεροποτάμου, στο σημείο όπου υπήρχε η αρχαία Αυλώνα, όπου και σχηματίζει σπουδαίο υδροβιότοτο. Το όνομά του σημαίνει «Ιερός Ποταμός», ενώ κοντά στην έξοδό του είναι γνωστός κι ως Αυλοπόταμος λόγω της αρχαίας Αυλώνας. Λίγο πριν την έξοδο στη θάλασσα, ενώνεται με το Μαργαριτιανό Ποταμό ή Μυλοπόταμο.
Αλμυρός Γεωργιούπολης 
Η λίμνη και το ποτάμι του Αλμυρού στην περιοχή της Γεωργιούπολης αποτελούν έναν από τους σπουδαιότερους υγροτόπους της δυτικής Κρήτης. Στη λίμνη συναντάμε αγριόπαπιες, νερόκοτες και πολλά άλλα υδρόβια πτηνά. Περιφερειακά της λίμνης δημιουργείται ένας φυσικός φράχτης από υδροχαρή φυτά, αγριοκαλαμιές και καλάμια, μυρτιές, πικροδάφνες και βάτα.
Ο ποταμός Κερίτης βρίσκεται κοντά στα Χανιά και ανήκει στα ποτάμια με τη μεγαλύτερη παροχή νερού στην Κρήτη. Συγκεντρώνει τα νερά των Λευκών Ορέων από την περιοχή της Ζούρβας και των Μεσκλών και έπειτα από πορεία που ξεπερνάει τα 25 χλμ καταλήγει στην παραλία του Πλατανιά. Στο διάβα του ενώνεται με πολλά ρέματα και παραπόταμους.
Ο υγρότοπος του Αλμυρού βρίσκεται πολύ κοντά στην πόλη του Αγίου Νικολάου, αποτελώντας ένα πραγματικό παράδεισο για την περιοχή. Πρόκειται για μια ελώδη περιοχή 48 στρεμμάτων που τροφοδοτείται μόνιμα με υφάλμυρο νερό από καρστικες πηγές. Η μέση ετήσια παροχή είναι περίπου 2000 λίτρα/δευτερόλεπτο.
Ο ποταμός Μπούτακας βρίσκεται στην επαρχία Αποκορώνου στα Χανιά πηγάζει από τα νερά των Λευκών Ορέων κοντά στον Βαφέ. Περνάει από το χωριό Βρύσες, όπου υπάρχουν πολλές όμορφες ταβέρνες, κι εκβάλει στην όμορφη παραλία Καλυβάκι στην Γεωργιούπολη, αφού πριν έχει αναμειχθεί με αλμυρό νερό.
Ο Γαζανός Ποταμός συγκεντρώνει τα νερά από τις ανατολικές πλαγιές του Ψηλορείτη και αποτελεί έναν από τους σημαντικότερους σε ροή ποταμούς της Κρήτης. Αρχικά συγκεντρώνει τα νερά από τις περιοχές των Ασιτών και του Κρουσώνα και στη συνέχεια ενώνεται με το Γωνιανό ρέμα.
