Το Ηράκλειο φιλοξένησε εξαιρετικούς ναούς, πρώην ανδρικά και γυναικεία μοναστήρια, ειδικά κατά την Ενετοκρατία. Η έδρα της Αρχιεπισκοπής Κρήτης βρίσκεται εδώ και υπάγεται απευθείας στο Οικουμενικό Πατριαρχείο Κωνσταντινουπόλεως. Δυστυχώς κυρίως στις αρχές του 20ου αιώνα πολλά από τα λαμπρά μνημεία κατεδαφίστηκαν για τον "εκμοντερνισμό" της πόλης.
- 1
- 2
Μουσείο Χριστιανικής Τέχνης - Αγία Αικατερίνη Σιναϊτών 
Το Μουσείο Εικόνων και Κειμηλίων Ιεράς Αρχιεπισκοπής Κρήτης στεγάζεται στον Ενετικό ναό της Αγίας Αικατερίνης των Σιναϊτών, στο κέντρο του Ηρακλείου, και δίπλα στο Μητροπολιτικό Ναό του Αγίου Μηνά.
Βασιλική Αγίου Μάρκου 
Η Δημοτική Πινακοθήκη του Δήμου Ηρακλείου φιλοξενείται στον χώρο της Βασιλικής του Αγίου Μάρκου στο κέντρο του Ηρακλείου. Η βασιλική κτίστηκε από τους Ενετούς το 1239, καταστράφηκε το 1303 από σεισμό και αναστηλώθηκε αμέσως.
Μητροπολιτικός Ναός Αγίου Μηνά 
Ο Μητροπολιτικός ναός είναι αφιερωμένος στον Άγιο Μηνά, τον προστάτη Άγιο των Καστρινών, συνδυάζοντας έτσι το θρύλο με την παράδοση και την ιστορία της πόλης. Κτίστηκε το 1862 και είναι ένας από τους πιο μεγαλοπρεπείς και επιβλητικούς ναούς της Ελλάδας.
Στη διάρκεια της B΄ Βυζαντινής περιόδου ο ναός του Αγίου Τίτου, ο επισημότερος και μεγαλύτερος στο Χάνδακα, γίνεται η Μητρόπολη της νέας Επισκοπής της Κρήτης. Αργότερα οι Βενετοί εγκαθιστούν στο ναό Λατίνο αρχιεπίσκοπο μετατρέποντάς τον σε Επισκοπή Λατίνων.
Ο Ναός Πέτρου και Παύλου χτίστηκε κατά τους πρώτους χρόνους της βενετσιάνικης κυριαρχίας ως Καθολικό της μονής του Τάγματος των Δομηνικανών (Domenicani Predicatori). Αποτελεί ένα από τα παλαιότερα μνημεία αρχιτεκτονικής των Κιστερκιανών Μοναχών του 12ου αιώνα.
Ο μικρός ναός του Αγίου Μηνά και της Παντάνασσας αναφέρεται στους καταλόγους των εκκλησιών του Χάνδακα της εποχής της Ενετικής κυριαρχίας. Μετά από πολύχρονη αχρησία, το 1735, ο ναός ανακαινίζεται και γίνεται η μητρόπολη της πόλης και έκτοτε κέντρο των ορθοδόξων χριστιανών του Oθωμανικού Χάνδακα.
Ο ναός του Αγίου Δημητρίου κοντά στο Ενετικό Λιμάνι του Ηρακλείου είναι κτισμένος στη θέση του παλαιότερου ναού του Αγίου Δημητρίου που ήταν ο προστάτης των μαραγκών του Ηρακλείου κατά την Ενετοκρατία.
Ο ναός του Αγίου Ονουφρίου βρίσκεται στην κεντρική αγορά του Ηρακλείου και είναι εντελώς άγνωστος στους περισσότερους καθώς είναι εγκλωβισμένος από διάφορα καταστήματα των οδών 1866, Τσικριτζή και Έβανς. Σήμερα μπορεί να δει κάποιος τον τρούλο του μέσα από την αγορά της οδού 1866 ή τις ταράτσες των παρακείμενων πολυκατοικιών, ενώ πρόσβαση στο εσωτερικό του ναού υπάρχει μέσα από το αρτοποιείο Τούλη.
- 1
- 2
