Η νησίδα Λαζαρέτα (Lazaretta) ή Λαζαρέτο βρίσκεται απέναντι από τη Νέα Χώρα και κατά τον 17ο αιώνα οι Ενετοί τη χρησιμοποίησαν ως λοιμοκαθαρτήριο των Χανίων, όπως ακριβώς γινόταν στα περισσότερα νησάκια απέναντι από πόλεις. Το όνομα της το παίρνει από τον Λάζαρο, τον προστάτη των λεπρών (στην Καθολική Εκκλησία).
Έχουν εντοπιστεί τάφοι, προφανώς ασθενών, ενώ διακρίνονται ακόμη οι βάσεις των κτιρίων που κατεδάφισαν οι Οθωμανοί το 1645 για να τοποθετήσουν μεγάλο κανόνι για την άλωση του κάστρου των Χανίων. Σε μερικά σημεία θα δείτε μεταλλικά θραύσματα από βόμβες που έπεφταν κατά τη διάρκεια στρατιωτικών ασκήσεων των Γερμανών κατά το Β’ Παγκόσμιο Πόλεμο. Χαρακτηριστικό είναι και το εικονοστάσι του Αγίου Νικολάου που έκτισε ένας ντόπιος το 1954. Ο άνθρωπος αυτός έπαθε ηλίαση στο νησί αλλά κατάφερε να κολυμβήσει ως τη Νέα Χώρα και να σωθεί. Στο νησί υπάρχει μια μικρή αμμουδερή παραλία με βυθό ιδανικό για μάσκα. Κατά τη δεκαετία του 1950, πραγματοποιούνταν κολυμβητικοί αγώνες από τα Λαζαρέτα ως το Ενετικό λιμάνι των Χανίων.