Το μουσείο λειτουργεί από το 1967 και ιδρύθηκε από το Σωματείο Αγωνιστών Εθνικής Αντίστασης – Ομάδες Μπαντουβά. Στεγάζεται στο σημερινό στρατολογικό γραφείο Ηρακλείου, το οικόπεδο του οποίου ανήκε στον αντάρτη της Εθνικής Αντίστασης, καπετάν Μανώλη Μπαντουβά.
Το Μουσείο Ιστορίας της Ταφής αποτελεί έναν πολύ ιδιαίτερο χώρο του Ηρακλείου. Στεγάζεται στο διώροφο οστεοφυλάκιο του παλαιού κοιμητηρίου των Αγίων Κωνσταντίνου και Ελένης, το οποίο χρονολογείται από το 1890 και παρουσιάζει την ιστορία της ταφής από τη μινωική εποχή ως και σήμερα.
Στο χωριό Έξω Λακώνια από το 2005 λειτουργεί μια εξαιρετική έκθεση κλασικών οχημάτων με πάνω από 110 ιστορικά οχήματα ιδιαίτερου συλλεκτικού ενδιαφέροντος από όλη την Κρήτη. Στο χώρο του Παγκρήτιου Συλλόγου Οχημάτων Εποχής λειτουργεί και μόνιμη έκθεση παλιάς φωτογραφίας αυτοκινήτων και μοτοσικλετών.
Το Ιστορικό Αρχείο Κρήτης ιδρύθηκε το 1920 με έδρα τα Χανιά το οποίο λειτούργησε άτυπα μέχρι το 1928 οπότε αναγνωρίσθηκε ως ΝΠΔΔ. Το 1943, με νομοθετικό διάταγμα έγινε Δημόσια Υπηρεσία ως παράρτημα των Γενικών Αρχείων του Κράτους.
Το Αργυράκειο Πολεμικό και Εθνολογικό Μουσείο στεγάζει μια πολύ σημαντική πολεμική συλλογή του ιδρυτή του Μιχάλη Αργυράκη στην Επισκοπή Πεδιάδος. Παρουσιάζονται οικογενειακά κειμήλια, στρατιωτικός εξοπλισμός από τον Β΄ Παγκόσμιο Πόλεμο, φωτογραφίες και έγγραφα.
Το Ιστορικό Μουσείο Βοριζίων «Ο Σπήλιος» βρίσκεται στο χωριό Βορίζια του Ηρακλείου και φιλοξενείται σε σπηλιά πάνω από το χωριό, όπου μέχρι και την ίδρυσή του χρησιμοποιούνταν για τυροκομία. Το μουσείο εγκαινιάστηκε στις 16 Αυγούστου 2014.
Το Μουσείο λειτουργεί από το 1968 και εγκαινιάστηκε το Σεπτέμβριο του 1993. Στεγάζεται σε κτίριο που αποτελεί χαρακτηριστικό δείγμα τοπικής παραδοσιακής αρχιτεκτονικής και αναπτύσσεται σε δύο επίπεδα.
Ένας από τους μαρτυρικούς τόπους είναι και τα Περβόλια των Εννιά Χωριών Κισάμου, από όπου κατάγεται και είχε το Αρχηγείο του ο οπλαρχηγός Αναγνώστης Σκαλίδης, ο οποίος δικαίως ονομάσθηκε ο Καραϊσκάκης της Κρήτης.