Το φαράγγι της Απολύχνου βρίσκεται λίγα χιλιόμετρα βόρεια από τις Μοίρες, σε μια κατάφυτη από ελαιώνες περιοχή. Ουσιαστικά πρόκειται για μια μεγάλη ρεματιά με ποτάμι, η οποία σε μερικά σημεία βαθαίνει, ενώ η βλάστηση σε πολλά σημεία είναι πολύ πυκνή.
Η Μονή του Αγιασμένου βρίσκεται 2km βόρεια της Ιεράπετρας, κοντά στον κεντρικό δρόμο που συνδέει την πόλη με τη Παχειά Άμμο. Ο ναός του μοναστηριού είναι αφιερωμένος στους Αγίους Πάντες και εδώ βρισκόταν στα τέλη του 19ου αιώνα η οικία του Επισκόπου Ιεράς και Σητείας.
Το Πρωτοβυζαντινό εκκλησάκι του Αγίου Νικολάου, του προστάτη των Ναυτικών, έχει δώσει το όνομα του σε ολόκληρη την πόλη. Το εκκλησάκι κτίστηκε στην άκρη του ακρωτηρίου Νησί μετά τον 7ο αιώνα και είναι ένα από τα παλαιότερα στην Κρήτη.
Η λίμνη της Λιβάδας βρίσκεται στην ομώνυμη περιοχή 1 χλμ βόρεια του χωριού Θραψανού και αποτελεί ένα από τα αγαπημένα μέρη των ντόπιων για περίπατο. Η έκταση της είναι μόλις 21 στρέμματα, αλλά αποτελεί έναν σημαντικό υδροβιότοπο της περιοχής, όπου έχουν παρατηρηθεί περισσότερα από 130 είδη πτηνών.
Η Αρχαιολογική Συλλογή Ιεράπετρας άρχισε να συγκροτείται στα τέλη του 19oυ αιώνα, όταν φιλάρχαιοι κάτοικοι της πόλης ίδρυσαν το Φιλεκπαιδευτικό Σύλλογο Ιεράπετρας, με σκοπό την περισυλλογή και τη διαφύλαξη των αρχαίων της περιοχής και τη δημιουργία μουσειακής συλλογής.
Το ανάκτορο των Αρχανών βρίσκεται στην περιοχή Τουρκογειτονιά των Άνω Αρχανών. Ήρθε στο φως μόλις το 1964 από το Γιάννη Σακελλαράκη, καθώς ως τότε είχαν εντοπιστεί ελάχιστα ίχνη του. Τμήματα του βρίσκονται ακόμα κάτω από τις σημερινές κατοικίες.
Το φρούριο Bonifacio ή Επάνω Καστέλι βρισκόταν δυτικά από το σημερινό χωριό Τσιφούτ Καστέλι, 44 χλμ νότια του Ηρακλείου, πάνω σε ύψωμα που σήμερα ονομάζεται Επάνω Καστέλλι ή Ψηλό Αλώνι. Το φρούριο αναφέρεται από το 1212 και κτίστηκε από τον Πεσκατόρε.
Πάνω και βόρεια από το χωριό Καβούσι Ιεράπετρας βρίσκεται καλά κρυμμένο το οροπέδιο Λάκκος του Αμπελιού το οποίο τους χειμερινούς μήνες γεμίζει νερό και δημιουργείται μία σειρά από διαφορετικές λίμνες. Στην άκρη του οροπεδίου ξεκινάει το μικρό αλλά εντυπωσιακά όμορφο φαράγγι της Αγριόμαντρας που οδηγεί στην παραλία της Αγριόμαντρας, μία από τις καλύτερα κρυμμένες και πιο όμορφες παραλίες της Ανατολικής Κρήτης.