Το Μουσείο Κρητικών Βοτάνων - Herbarium Jacques Zaffran, εγκαινιάσθηκε το 2008, κατά τη διάρκεια διεθνούς συνεδρίου με θέμα Οικολογική Θεολογία και Περιβαλλοντική Ηθική. Στεγάζεται σε κτήριο της Ορθοδόξου Ακαδημίας Κρήτης, δίπλα στη μονή Γωνιάς και εκθέτει τα περίπου 9.000 βότανα της Συλλογής Κρητικών Βοτάνων, που πρόσφερε ο Γάλλος Καθηγητής της Βοτανικής Jacques Zaffran.
Ο διακεκριμένος αυτός επιστήμονας έχει αφιερώσει τη ζωή του στην επιστημονική μελέτη της πλούσιας χλωρίδας της Κρήτης από το 1964. Από το 2004 έχει εγκατασταθεί μόνιμα στην Κρήτη, προκειμένου να συνεχίσει τη μελέτη των βοτάνων και τον εμπλουτισμό της συλλογής και να διευκολύνει την κατά το δυνατόν καλύτερη αξιοποίησή της.
Το Μουσείο Κρητικών Βοτάνων περιλαμβάνει αίθουσα - εκθετήριο, εργαστήριο και δωμάτια για τη φιλοξενία ερευνητών.