Ο «Σπήλιος του Φραγκαντώνη» βρίσκεται περίπου 700μ νότιο-νοτιοδυτικά των Μαλίων, στους πρόποδες του βουνού Βολακιάς, σε υψόμετρο μόλις 20μ, κάτω, κυριολεκτικά, από τη νέα Εθνική οδό. Η σπηλιά έχει δύο εισόδους. Μια χαμηλή και μια από την οροφή της. Η χαμηλή έχει βόρειο προσανατολισμό, με πλάτος περίπου ένα μέτρο αλλά η πρόσβαση από εκεί είναι λίγο δύσκολη λόγω των πετρωμάτων που έχουν συγκεντρωθεί από τα νερά της βροχής. Η συγκέντρωση, με τα έργα της νέας εθνικής οδού, θα πρέπει να είναι πιο έντονη εξαιτίας των κλίσεων του εδάφους και από την υδροροή που οδηγεί τα νερά της εθνικής κοντά στην είσοδο του σπηλαίου.
Από την είσοδο, σχηματίζεται διάδρομος 2 μέτρων και δεξιά του υπάρχει εγκοπή κατάμαυρη από καπνιά. Έρποντας κατηφορικά, υπάρχει μια ωοειδής αίθουσα λευκού κρητιδικού ασβεστολίθου διαστάσεων 16Χ10 περίπου. Στο κέντρο της, ένας εντυπωσιακός όγκος λιθωματικού υλικού με έντονο φυσικό διάκοσμο, ένα είδος τριώροφου στύλου ύψους 4μ. τραβάει αμέσως το βλέμμα. Το έδαφος είναι στρωμένο με χώμα και χαλίκι γιατί η σπηλιά χρησιμοποιήθηκε ως καταφύγιο από στρατιώτες το 1944. Περιέχει οστά και δόντια ζώων, όστρακα απροσδιόριστης ηλικίας. Γύρω από τη σπηλιά υπάρχουν αρκετά φθαρμένα όστρακα και είναι πιθανό να χρησιμοποιήθηκε κατά την ελληνιστική και ρωμαϊκή εποχή. Σε κοντινή απόσταση, ανατολικά της σπηλιάς, υπήρχε οικισμός της Πρωτομινωϊκής εποχής.