Η επαρχία της Ιεράπετρας φιλοξένησε έναν μεγάλο αριθμό μονών που δεν λειτουργούν σήμερα, κυρίως στις ορεινές περιοχές της Δίκτης κοντά στα σύνορα με την επαρχία της Βιάννου αλλά και στη οροσειρά της Θρυπτής.
Ναός Αγίας Ειρήνης στην Αύγο 
Ο ναός της Αγίας Ειρήνης στην κοιλάδα της Αύγου στην περιφέρεια του Καβουσίου Ιεράπετρας χρονολογείται στον 14ο αιώνα και φέρει τοιχογραφίες του 1410-1411. Ο ναός πιστεύεται ότι υπήρξε καθολικό μικρής γυναικείας μονής, αλλά δε σώζονται άλλα κτίσματα.
Το χωριό Σταυρός Ιεράπετρας, γνωστό με το παλαιότερο όνομα Καπίστρι, διασώζει αρκετά μεγάλο αριθμό ναών, γεγονός που υποδεικνύει την ακμαία του πορεία στο παρελθόν. Ένας από τους πιο εντυπωσιακούς ναούς του βρίσκεται λίγα μέτρα νότια από τον οικισμό και ονομάζεται Κάτω Άη Γιώργης.
Ο ναός της Παναγίας στην τοποθεσία Γουρνί βρίσκεται σε ρεματιά βόρεια του χωριού Καπίστρι, στο δρόμο για την Παναγία Κεραγραμμένη. Σύμφωνα με την παράδοση το όνομα Γουρνί προήλθε από μικρή γούρνα που οι μοναχοί είχαν τοποθετήσει στον παρακείμενο ποταμό για να παίρνουν νερό.
Ο μικρός μονόχωρος ναός του Αγίου Μάμα βρίσκεται βόρεια του χωριού Καπίστρι ή Σταυρός της επαρχίας Ιεράπετρας, πολύ κοντά στη Μονή της Παναγίας στο Γουρνί και στο ναό της Αγίας Σοφίας.
Ο ναός του Αγίου Γεωργίου βρίσκεται κοντά στο κέντρο του χωριού Μεσελέροι της επαρχίας Ιεράπετρας. Ο τοιχογραφικός του διάκοσμος χρονολογείται περίπου στο 1300 και σώζεται αποσπασματικά.
Ο ναός των Αγίων Αποστόλων Πέτρου και Παύλου βρίσκεται στην τοποθεσία Κάτω Καρκάσα στην περιφέρεια του χωριού Ανατολή Ιεράπετρας. Ο ναός αποτέλεσε το καθολικό της ερειπωμένης σήμερα Μονής Καρκασίων, από την οποία σώζονται ελάχιστα ίχνη κτιρίων νότια του ναού. Η μονή Καρκασίων είχε στην επικράτειά της και το ναό του Σωτήρος στα Κάτω Καρκάσα.
Ο ναός του Σωτήρος Χριστού βρίσκεται στην τοποθεσία Πάνω Καρκάσα στην περιφέρεια του χωριού Ανατολή Ιεράπετρας. Ο ναός αποτέλεσε τμήμα της ερειπωμένης σήμερα Μονής Καρκασίων, τα κελιά της οποίας ίσως βρισκόντουσαν στα διπλανά κτίρια που αργότερα ανακατασκευάστηκαν σε κατοικίες.
Ο ναός της Παναγίας της Παντάνασσας Βαγιωνέας είναι αφιερωμένος στη Ζωοδόχο Πηγή και βρίσκεται στην τοποθεσία Βαγιωνιά της περιφέρειας της Ανατολής Ιεράπετρας. Είναι κτισμένος σε δύσβατη αγροτική περιοχή, γεμάτη από θερμοκήπια, και αποτέλεσε καθολικό της γυναικείας μονής Παντάνασσας.
