Η τεχνητή λίμνη της Αγιάς βρίσκεται δίπλα στο ομώνυμο χωριό Αγιά της επαρχίας Κυδωνίας, 9 χλμ δυτικά των Χανίων. Είναι μια μικρή λίμνη έκτασης 450 στρεμμάτων, η οποία επικοινωνεί νότια με την κοιλάδα του Φασά. Η κοιλάδα αυτή θεωρείται ως η πιο υγρή της Κρήτης, καθώς δέχεται το νερό των Λευκών Ορέων μέσω πολλών υπόγειων πηγών και του ποταμού Ξεκωλωμένου. Η λίμνη ήταν ένας βάλτος, πριν η ΔΕΗ τη μετατρέψει σε τεχνητή, για την παραγωγή υδροηλεκτρικής ενέργειας. Πλέον, το εργοστάσιο της ΔΕΗ δεν λειτουργεί, αλλά ο επισκέπτης μπορεί ακόμη να δει τις παλιές εγκαταστάσεις του μέσω διαμορφωμενου μουσειακού χώρου.
Η μικρή αυτή λίμνη φιλοξενεί ίσως την μεγαλύτερη ποικιλία υδροχαρών φυτών στην Κρήτη, αλλά και πολύ σημαντικά είδης πανίδας, όπως σπάνια είδη φτέρης και βατράχων. Επίσης, στην λίμνη βρίσκουν καταφύγιο πολλά αποδημητικά, και μη, πουλιά. Η οικολογική σημασία της λίμνης της Αγιάς αντικατοπτρίζεται και στο γεγονός ότι η λίμνη προστατεύεται από διεθνείς συνθήκες.
Τα τελευταία χρόνια, τα αρδευτικά έργα της περιοχής έχουν μειώσει το μέγεθος της, η οποία έχει γίνει βάλτος σε πολλά σημεία. Επίσης, σοβαρή θεωρείται η οικολογική καταστροφή που προκάλεσαν ανεγκέφαλοι ντόπιοι, όταν απελευθέρωσαν αμερικανικούς βουβαλοβάτραχους στη λίμνη πριν από κάποια χρόνια. Οι βάτραχοι πολλαπλασιάστηκαν ανεξέλεγκτα, αφανίζοντας τον ενδημικό βάτραχο της Κρήτης. Αυτό το γεγονός, σε συνδυασμό με την εισαγωγή του λατινοαμερικάνικου ζιζανίου Papsalum distichum που έχει καλύψει τη λίμνη, αποτελούν τους κυριότερους λόγους της αλλοίωσης της βιοποικιλότητας της λίμνης. Προσπάθειες γίνονται ώστε να μην εξαπλωθούν αυτά τα ξενόφερτα είδη και σε άλλους υδροβιότοπους της Κρήτης.