Ο Υγρότοπος του Αλμυρού βρίσκεται πολύ κοντά στην πόλη του Αγίου Νικολάου, αποτελώντας ένα πραγματικό παράδεισο για την περιοχή της Ανατολικής Κρήτης. Πρόκειται για μια ελώδη περιοχή 48 στρεμμάτων που τροφοδοτείται μόνιμα με υφάλμυρο νερό από καρστικές πηγές. Η μέση ετήσια παροχή είναι περίπου 2000 λίτρα/δευτερόλεπτο.
Το μεγαλύτερο μέρος της οριοθετημένης περιοχής καταλαμβάνει καλαμιώνας του είδους Phragmites australis. Επίσης υπάρχουν Μεσογειακά αλίπεδα με βούρλα και αλμυρίκια. Στο παράκτιο τμήμα, που έχει περιοριστεί λόγω της εκμετάλευσης της παραλίας του Αλμυρού, συναντάμε το κρινάκι της θάλασσας (Pancratium maritimum). Στην ευρύτερη περιοχή έχουν δυστυχώς εισαχθεί ξενικά είδη, όπως ευκάλυπτοι και φοίνικες.
Στον Αλμυρό βρίσκουν τροφή, καταφύγιο και ιδανικές συνθήκες ανάπτυξης πολλά είδη πανίδας, κυρίως πτηνά. Πάπιες, ερωδιοί και γλάροι εμφανίζονται όλο το έτος. Επίσης ο υγρότοπος αποτελεί χώρο ξεκούρασης και ανεφοδιασμού για τα μεταναστευτικά πουλιά κατά τη διάρκεια της εαρινής και φθινοπωρινής μετανάστευσης.
Η ονομασία «Αλμυρός» υπάρχει και σε ακόμη δύο σπουδαίους υδροβιότοπους της Κρήτης, τον Αλμυρό Ηρακλείου και τον Αλμυρό της Γεωργιούπολης.