Στο Ρέθυμνο υπάρχουν αρκετά προσβάσιμα όμορφα φαράγγια. Το πιο γνωστό είναι το Κουρταλιώτικο Φαράγγι, μέσα από το οποίο περνάει ο Μεγάλος Ποταμός που καταλήγει στην πανέμορφη λίμνη του Πρέβελη με το ονειρικό φοινικόδασος. Η πορεία μέσα από την κοίτη του φαραγγιού, το οποίο έχει τη μεγαλύτερη ποσότητα νερού από όλα τα φαράγγια της Κρήτης, ως την έξοδό του είναι μια μοναδική εμπειρία. Άλλα γνωστά φαράγγια που προσφέρονται για πεζοπορία είναι τα Κολλητά στην περιοχή της Αργυρούπολης, του Κοτσυφού που καταλήγει στον Πλακιά, του Αγίου Αντωνίου στην Πατσό και το Πρασανό, των Πλατανιών ενώ κοντά στην πόλη του Ρεθύμνου βρίσκονται τα καταπράσινα φαράγγια των Μύλων, των Βεδέρων και του Γάλλου.
Φαράγγι Βεδέρων 
Το καταπράσινο φαράγγι των Βεδέρων ξεκινά από τον οικισμό Φρατζεσκιανά μετόχια, περνάει δίπλα από τον οικισμό Βεδέροι και καταλήγει στην παραλία του Γερανίου μετά από 7km.
Το Κισσανό φαράγγι βρίσκεται 1km βόρεια του χωριό Κισσός της επαρχίας Αγίου Βασιλείου και 34km νοτιοανατολικά του Ρεθύμνου, ενώνοντας το μικρό χωριό με το οροπέδιο του Γιους Κάμπου. Είναι ένα μικρό, αλλά όμορφο φαράγγι, μέσα από το οποίο διασχίζει σε ένα σημείο ο επαρχιακός δρόμος που οδηγεί από τον Κισσό στο Γιους Κάμπο.
Στο μικρό και σχεδόν έρημο σήμερα χωριό Χορδάκι στην επαρχία Αμαρίου συναντάμε το μικρό αλλά πολύ όμορφο φαράγγι που δημιουργείται στην περιοχή Κυνηγόσπηλιος κάτω από το χωριό και προς τα νότια του. Βρίσκεται σε εντελώς κρυφό σημείο και δε φαίνεται από πουθενά και αυτός είναι και ο βασικός λόγος που παραμένει άγνωστο.
Κάτω από το χωριό Μύρθιος στο βόρειο Ρέθυμνο (όχι ο Μύρθιος Αγίου Βασιλείου πάνω από τον Πλακιά) δημιουργείται μία μικρή λαγκαδιά με πλατάνια η οποία στην έξοδό της δημιουργεί ένα καλά κρυμμένο πολύ μικρό και άγριο φαράγγι στην περιοχή Καμινόλακκος. Καμινόλακκος σημαίνει το ασβεστοκάμινο στο τοπικό ιδίωμα και το πέτρωμα της περιοχής είναι ιδανικό για την παρασκευή ασβέστη.
Το πολύ όμορφο φαράγγι της Συκιάς αποτελεί ουσιαστικά το ανατολικότερο φαράγγι της επαρχίας Σφακίων και σχηματίζεται βόρεια από το χωριό Ροδάκινο. Αποτελεί τεχνικό φαράγγι, δηλαδή η διάσχισή του απαιτεί χρήση τεχνικού εξοπλισμού καθώς στην πορεία του σχηματίζονται περισσότερες από 10 απότομες καταβάσεις (καταρράκτες), οι οποίες έχουν ασφαλιστεί με ρελέ από τους σπηλαιολογικούς συλλόγους της Κρήτης.
Ο Άγιος Αντώνιος είναι τεχνικό φαράγγι, δηλαδή η διάσχισή του απαιτεί τεχνικά μέσα canyoning, καθώς έχει δέκα καταρράκτες, με το μεγαλύτερο και πιο εντυπωσιακό στα 60 μέτρα.
