Η Μονή Ασωμάτων βρίσκεται 35km νοτιοανατολικά του Ρεθύμνου, στο μέσο μιας κατάφυτης κοιλάδας του Αμαρίου που σχηματίζεται ανάμεσα στο Όρος Κέδρος και στον Ψηλορείτη. Ο ναός της μονής είναι αφιερωμένος στους Ταξιάρχες (=Ασώματοι).
Ο ναός του Αγίου Ιωάννη του Θεολόγου βρίσκεται στην τοποθεσία Φωτί και ήταν το καθολικό μικρής μονής. Φέρει τοιχογραφίες δύο φάσεων: του 13ου αιώνα και του 14-15ου αιώνα. Ο γύρω χώρος έχει διαμορφωθεί σε παρκάκι.
Χτισμένο σε περίοπτη θέση με μοναδική θέα στον Ψηλορείτη το Βένι (ανηφόρα στο κρητικό ιδίωμα) χρησιμοποιήθηκε από τη Μινωική εποχή σα λατρευτικό σπήλαιο και παντού συναντά κανείς ακόμα και σήμερα όστρακα.
Πάνω από το χωριό Άνω Μέρος, στο Όρος Κέντρος, βρίσκεται η παλιά Μονή της Καλόειδενας, που δε λειτουργεί πλεόν, με τον αναστηλωμένο βυζαντινό ναό αφιερωμένο στον Αφέντη Χριστό. Σήμερα, εκτός από την εκκλησία, δε σώζονται πολλά από το μοναστήρι,.
Κάτω από τον οικισμό Βρύσες Αμαρίου συναντάμε τον οικισμό φάντασμα του Σμιλέ, ο οποίος έχει εγκαταλειφθεί από τα μέσα του 20ου αιώνα. Ο οικισμός κατά την Τουρκοκρατία ήταν Τουρκοχώρι, αλλά παρόλα αυτά διατήρησε το Χριστιανικό ναό της Παναγίας, ο οποίος σώζεται έως και σήμερα σε τραγική κατάσταση.
Ο Ναός του Αγίου Νικολάου στα Πλατάνια της επαρχίας Αμαρίου βρίσκεται δυτικά του χωριού, κάτω από το δρόμο που οδηγεί στη Βισταγή. Είναι μικρός μονόχωρος καμαροσκέπαστος ναός που φέρει στο εσωτερικό του τοιχογραφίες του 14ου αιώνα σε μέτρια κατάσταση.
Ο ναός της Παναγίας στα Πλατάνια Αμαρίου βρίσκεται στο κέντρο του χωριού και είναι μονόχωρος καμαροσκέπαστος με ημικυλινδρική αψίδα. Είναι αφιερωμένος στην Κοίμηση της Θεοτόκου και εορτάζει το Δεκαπενταύγουστο. Ο ναός χρονολογείται στον 13ο - 14ο αιώνα και φέρει στο εσωτερικό του τοιχογραφίες της ίδιας περιόδου.
Στο κοιμητήριο του χωριού Παντάνασσα της επαρχίας Αμαρίου συναντάμε τον εντυπωσιακό δίκλιτο ναό που είναι αφιερωμένος στον Άγιο Ιωάννη τον Πρόδρομο και στην Αγία Τριάδα. Ο ναός κτίστηκε το 1645 και κτήτοράς του ήταν το Μανώλης Βλαστός. Εντύπωση προκαλούν οι θύρες με τα γοτθικά στοιχεία, ενώ στο εσωτερικό του σώζεται θολωτός τάφος που χρονολογείται στο 1594.