Το Αρχαιολογικό Μουσείο Χανίων βρίσκεται στην ιστορική συνοικία της Χαλέπας, στην πόλη των Χανίων.
Η μινωική Κυδωνία ήταν κτισμένη στη σημερινή περιοχή της παλιάς πόλης των Χανίων. Η Κυδωνία ήταν η τρίτη μεγαλύτερη πόλη της μινωικής Κρήτης. Ανέπτυξε ακμαία βιοτεχνία και πλούτισε μέσα από το θαλάσσιο εμπόριο, το οποίο ευνοούσε η θέση της. Μάλιστα, οι αρχαίοι συγγραφείς αναφέρουν την Κυδωνία ως τη μητέρα των Κρητικών Πόλεων.
Το μουσείο στεγάζεται από το 1997 στο καθολικό της μονής του San Salvatore, χρονολογείται πιθανότατα στο 15ο αιώνα, δίπλα στον ομώνυμο προμαχώνα, στη δυτική πλευρά των ενετικών οχυρώσεων.
Ο σημερινός μητροπολιτικός ναός των Χανίων του 1860, αφιερωμένος στα Εισόδια της Θεοτόκου κτίστηκε στη θέση παλαιότερου Ενετικού ναού της Παναγίας. Μετά την άλωση της πόλης από τους Οθωμανούς το 1645, ο ναός μετατράπηκε σε σαπωνοποιείο και ανήκε στον Μουσταφά Πασά Γκιριτλή (Κρητικό). Στο χώρο της ελαιαποθήκης φυλασσόταν η εικόνα της Παναγίας με άσβεστο καντήλι, σύμφωνα με διαταγή του Μουσταφά.
Στο κέντρο της παλιάς πόλης, κατηφορίζοντας προς το λιμάνι από την οδό Χάληδων, υπάρχει το ιδιωτικό Λαογραφικό Μουσείο «Κρητικό σπίτι» το οποίο δημιουργήθηκε από το μεράκι δύο γυναικών, της Ασπασίας Μπικάκη και της Ειρήνης Κουμανδράκη.
Στην είσοδο του λιμανιού των Χανίων βρίσκεται το Φρούριο Φιρκά όπου την 1η Δεκεμβρίου 1913 υψώθηκε η Ελληνική σημαία επισφραγίζοντας την Ένωση της Κρήτης με τη μητέρα Ελλάδα.
Το πατρικό του Ελευθερίου Βενιζέλου στη Χαλέπα Χανίων αποτέλεσε τη στέγη της ζωής του επί 30 και πλέον χρόνια, από το 1880 μέχρι το 1910 και αργότερα κατά διαστήματα από το 1927 μέχρι το 1935.
Οι Μουρνιές είναι η γενέτειρα του Ελευθερίου Βενιζέλου και εκεί σώζεται το σπίτι που γεννήθηκε, το οποίο σήμερα λειτουργεί ως μουσείο. Ο επισκέπτης μπορεί να δει την παιδική κούνια του Βενιζέλου, η οποία διατηρείται, καθώς και πλούσιο φωτογραφικό υλικό με χαρακτηριστικά στιγμιότυπα από την προσωπική και πολιτική του πορεία.