Η επαρχία Πεδιάδος αποτελεί ένα από τα σπουδαιότερα θρησκευτικά πάρκα της Κρήτης, με κατάγραφους ναούς και γραφικά ξωμονάστηρα διάσπαρτα σε όλη της την έκταση. Εξέχουσα θέση σε αριθμό και αισθητική μνημείων έχει η περιοχή της σημερινής Επισκοπής, η οποία αποτέλεσε επισκοπική έδρα.
Ναός Χριστού Σωτήρος στο Σμάρι 
Πολύ κοντά στην έρημη σήμερα μονή του Προφήτη Ηλία και λίγο πριν την αρχαία ακρόπολη του Σμαρίου βρίσκεται ο λιτός μονόχωρος ναός της Μεταμόρφωσης του Σωτήρος Χριστού, το εσωτερικό του οποίου φέρει τοιχογραφίες του 14ου αιώνα. Ανάμεσα στις τοιχογραφίες που διακρίνονται ακόμη περιλαμβάνονται σκηνές από το Δωδεκάορτο (δηλαδή τις δώδεκα σημαντικές γιορτές του έτους), διάφοροι άγιοι, συλλειτουργούντες ιεράρχες και η Δέηση.
Κάτω από την Ακρόπολη του Σμαρίου όπου πιστεύεται από κάποιους ότι υπήρξε η αρχαία Λύκτος, σε σημείο όπου υπάρχει πηγή νερού, λειτούργησε το μικρό μοναστήρι του Προφήτη Ηλία. Η θέα από το σημείο αυτό στον Σμαριανό κάμπο είναι μοναδική, ενώ εξαιρετικό ενδιαφέρον παρουσιάζουν οι γεωλογικοί σχηματισμοί γύρω από το μοναστήρι. Το ιερό του ναού βρίσκεται στο σημείο όπου αναβλύζει η πηγή που προφανώς υδροδότησε παλαιότερα την αρχαία πόλη και έδωσε ζωή στις καλλιέργειες των κατοίκων σε αυτόν τον αφιλόξενο βραχώδη τόπο.
Ο δίκλιτος ημισπηλαιώδης ναός του Αγίου Χαραλάμπου και του Αγίου Νικολάου βρίσκεται μέσα στον οικισμό Σκοτεινό και έχει ανεμπόδιστη θέα στη θάλασσα των Γουβών. Εσωτερικά, λόγω του λαξεύματος, έχει ακανόνιστο σχήμα και τα δύο κλίτη ενώνονται μεταξύ τους με μεγάλη καμάρα.
Έξω από το χωριό Γαλατάς και πολύ κοντά στο Μινωικό Ανάκτορο συναντάμε το δίκλιτο ναό του Αγίου Ιωάννη στην τοποθεσία Δρακονερό. Ο ναός της Βυζαντινής εποχής φέρει τοιχογραφίες σε πολύ κακή κατάσταση, ενώ στο εσωτερικό του υπάρχει αρκοσόλιο (ταφικό μνημείο) πιθανώς του κτήτορα. Κοντά στο ναό υπάρχει πηγάδι με νερό.
Η Βυζαντινή εκκλησία του Αγίου Παντελεήμονα που θεωρείται ότι είναι μία από τις παλαιότερες στην Κρήτη είναι κτισμένη σε όμορφο φυσικό περιβάλλον και βρίσκεται 3 χιλιόμετρα περίπου έξω από το Καστέλι Πεδιάδος του νομού Ηρακλείου.
Ένα από τα εκκλησάκια της Κρήτης που γιορτάζουν την ημέρα του Αγίου Γεωργίου του Μεθυστή, όταν πρωτανοίγουν τα βαρέλια με το κρασί, είναι ο Άγιος Γεώργιος στο χωριό Απόστολοι Πεδιάδος Ηρακλείου, ένα χωριό με μεγάλη παράδοση στην παραγωγή κρασιού.
Στο κέντρο του χωριού Ευαγγελισμός, γνωστό κι ως Μουχτάροι (η Μουρτάροι), βρίσκεται ο ναός του Ευαγγελισμού της Θεοτόκου, από τον οποίο παίρνει το χωριό το όνομά του. Στον εξωτερικό τοίχο υπάρχει πλάκα από την αρχαία Λύττο, ενώ στο εσωτερικό σώζονται λίγες αλλά εξαιρετικές τοιχογραφίες του 14ου αιώνα.
Στο Καστέλλι Πεδιάδος υπάρχει ο παλιός ναός του Χριστού, ο οποίος σώζει ίχνη τοιχογραφιών μεγάλης καλλιτεχνικής αξίας του 14ου αιώνα. Στις τοιχογραφίες διακρίνονται σκηνές της Πεντηκοστής, της Ετοιμασίας του Θρόνου, διάφοροι Άγιοι, η Δέηση, ο Άγιος Γεώργιος και ο Αρχάγγελος Μιχαήλ με στρατιωτική ενδυμασία και ξίφος, ως προστάτης του ναού.
