Στις Αρχάνες συναντάμε το μοναδικό μουσείο - ιδιωτική συλλογή exlibris και χαρακτικών στην Ελλάδα. Στα εκθέματα περιλαμβάνονται λιθογραφίες, βιβλιόσημα, ελεύθερα γραφικά, μικρογραφίες, κλπ.
Η Αρχαιολογική και Λαογραφική Συλλογή Μύρτους λειτουργεί από το 2001 και φιλοξενεί τη συλλογή του Γεωργίου Δημητριανάκη. Η αρχαιολογική έκθεση περιλαμβάνει μερικά από τα ευρήματα των αρχαιολογικών χώρων Πύργος και Φούρνου Κορυφή, αλλά και από άλλα σημεία της περιοχής.
Στον Άγιο Ιωάννη Μυλοπόταμου, 40km νοτιοανατολικά του Ρεθύμνου, βρίσκεται ένα ενετικό οίκημα, «Αρχοντικό», κάποιου Ενετού άρχοντα, που είχε εξισλαμηθεί τα πρώτα χρόνια της Τουρκοκρατίας.
Στον Παπαδιόκαμπο έχει εντοπιστεί Μινωική οικία ψαράδων και αγροτών εκτάσεως 130τμ, η οποία μας έχει δώσει εξαιρετικά στοιχεία για τη διατροφή των Μινωιτών. Φαίνεται ότι η οικία καταστράφηκε ξαφνικά ενώ μαγείρευαν οι νοικοκυρές Μινωίτισες, οι οποίες ευτυχώς μάλλον κατάφεραν να σωθούν, μένοντας όμως νηστικές. Δεν είχε όμως την ίδια τύχη κι ο σκύλος της οικίας που βρέθηκε πλακωμένος κάτω από τη πεσμένη στέγη.
Το Ρουστίκων Μέλαθρον φιλοξενεί την Ελληνική Λαογραφική Κοινότητα Χορού και Τραγουδιού, το Χορευτικό Σύλλογο Παρθενών και μουσείο παραδοσιακής ενδυμασίας από όλη την Ελλάδα, από τη συλλογή της Καίτης Καρεκλά και του Ανδρέα Φραγκιαδάκη.
Στα Ανώγεια Ρεθύμνου λίγο μετά το οροπέδιο της Νίδας στη βόρεια πλευρά του Ψηλορείτη βρίσκεται η τοποθεσία Βαθύ Λακκί. Είναι πάνω στο δρόμο που οδηγεί στο ερειπωμένο χιονοδρομικό κέντρο του Ψηλορείτη. Το όνομά του σημαίνει βαθύς λάκκος επειδή δημιουργείται στην περιοχή ένα μικρό ίσιωμα με λίγο χώμα στο κατά τα άλλα άγονο περιβάλλον της περιοχής.
Στο Μάραθος στεγάζεται από το 2009 η συλλογή έργων του γλύπτη Γιάννη Κλινάκη. Η ανθρώπινη φιγούρα είναι το βασικό θέμα της δουλειάς του σε μέταλλο, μάρμαρο και ξύλο. Παρουσιάζεται μια σειρά με Κρητικές ανθρωπόμορφες λύρες, αγωνιστές του ΄21 και της Εθνικής Αντίστασης.