Το Τζαμί του Καρα Μουσά Πασά στο Ρέθυμνο πήρε το όνομά του από τον ναύαρχο των Τούρκικων δυνάμεων κατάληψης του Ρεθύμνου, το έτος 1646. Στο σημείο αυτό, ήδη από την Ενετοκρατία, λειτουργούσε η μονή της Αγίας Βαρβάρας, από την οποία δεν διασώζεται κάτι. Το τέμενος ανήκει στον οθωμανικό αρχιτεκτονικό τύπο του τσεσμέ, με τετράπλευρη θολωτή δεξαμενή και διαμορφωμένες δυο κύριες όψεις.
Λίγο παραπέρα από το κεντρικό κτίριο του τεμένους βρίσκεται ο μιναρές, ενώ στην αυλή συναντάμε την κρήνη που εξυπηρετούσε τόσο τις ανάγκες ύδρευσης, όσο και τους μουσουλμάνους πιστούς που πρέπει να πλένονται πριν την είσοδο στο ναό του Μωάμεθ. Στην αυλή επίσης διασώζονται επιτύμβιες στήλες και ένας τουρμπές (θολωτό ταφικό μνημείο), στον οποίο ίσως είχε ενταφιαστεί ο κτήτορας του τζαμιού.