Στο Ηράκλειο υπάρχουν πολλά φαράγγια, με τα περισσότερα από αυτά να διασχίζουν τους όγκους του Ψηλορείτη και των Αστερουσίων Ορέων. Τα Αστερούσια διαθέτουν υπέροχα πεζοπορικά φαράγγια, με πιο σημαντικά του Αγιοφάραγγου, του Μάρτσαλου και του Τράφουλα. Ωστόσο, το διασημότερο φαράγγι είναι του Γάφαρη στον Ψηλορείτη, που διασχίζει το μαγευτικό δάσος του Ρούβα. Άλλα φαράγγια του Ψηλορείτη είναι του Κρουσώνα, μέσα από το οποίο διερχόταν το Μινωικό μονοπάτι για το Ιδαίον Άντρον, του Βρωμονερού, το Βοριζανό και τα δύο μικρά φαράγγια των Ασιτών. Κοντά στην πόλη, υπάρχουν τα καταπράσινα φαράγγια του Καρτερού, το Κουναβιανό, το Αρχανιώτικο, του Αλμυρού και του Βενεράτου. Στις δυτικές υπερώιες των Λασιθιώτικων βουνών υπάρχουν επίσης τα φαράγγια της Ρόζας, της Αμπέλου, της Αποτύπωσης και κοντά στη Χερσόνησο το φαράγγι του Αποσελέμη.
Εκτός από τα περιπατητικά αυτά φαράγγια, κυρίως η περιοχή των Αστερουσίων Ορέων στο νότιο Ηράκλειο φιλοξενεί πολλά τεχνικά φαράγγια, που έχουν ασφαλιστεί και χρησιμοποιούνται συχνά για την εκπαίδευση νέων canyoners.
Το Κνωσανό Φαράγγι (ή φαράγγι της Αγ. Ειρήνης) αποτελεί φυσική συνέχεια του όρους του Γιούχτα με συνολικό μήκος διαδρομής 5,7 χλμ.. Εκτείνεται νότια των Αρχανών (Άγιος Μάμας), διατρέχει τον οικισμό των Αρχανών στη θέση Κάτω Μύλος, όπου αρχίζει το κομμάτι που είναι γνωστό ως Συλαμιανό φαράγγι.
Το φαράγγι της Τρυπητής βρίσκεται στα Αστερούσια Όρη, νότια από το χωριό Βασιλική. Το μήκος του φαραγγιού είναι περίπου 4χλμ και στην έξοδό του σχηματίζεται μια πολύ όμορφη παραλία με ψιλό βότσαλο. Στην παραλία καταλήγει στριφογυριστός χωματόδρομος που διέρχεται παράλληλα με τις ανατολικές πλευρές του φαραγγιού για αρκετά χιλιόμετρα πριν καταλήξει μέσα στην κοίτη του, λίγο πριν την έξοδό του στη θάλασσα.
Υπάρχουν αρκετά μέρη στην Κρήτη που μπορούν πολύ εύκολα να κερδίσουν το χαρακτηρισμό ‘’όμορφα’’ αλλά σίγουρα όχι όλα από αυτά θα μπορούσαμε να τα χαρακτηρίσουμε ‘’θαύματα’’ της φύσης. Ένα από τα μέρη είναι το φαράγγι της Άρβης
Το φαράγγι του Αποσελέμη το συναντάμε στο χωριό Αγριανά (ή Αντριανά όπως το λένε οι Λασιθιώτες κάτοικοί του των οποίων υπήρξε πάντα μετόχι) Πεδιάδος Ηρακλείου πάνω από τη Χερσόνησο. Πρόκειται για το μεγαλύτερο και σημαντικότερο γεωλογικά φαράγγι σε όλο το βόρειο τμήμα του νομού Ηρακλείου.
Το φαράγγι της Ρόζας αποτελεί παρακλάδι του φαραγγιού της Αμπέλου. Ξεκινά από σημείο δίπλα στον αγροτικό δρόμο που διασχίζει το φαράγγι της Αμπέλου και με κατεύθυνση ανατολική-νοτιοανατολική, οδηγεί στην Κερά. Η κλίση της κοίτης του φαραγγιού είναι πολύ μεγάλη, αλλά μπορεί να αποτελέσει μονοπάτι για ορειβασία.
Για να φτάσετε στην παραλία του Τράφουλα αξίζει να περπατήσετε στο μικρό φαράγγι της περιοχής. Το φαράγγι έχει νερό το χειμώνα, ενώ είναι ουσιαστικά μικρό τμήμα ενός μεγαλύτερου φαραγγιού που ξεκινάει σε ψηλότερο υψόμετρο.
Το άγνωστο φαράγγι του Βενεράτου βρίσκεται 17km νότια του Ηρακλείου, πολύ κοντά στο χωριό Βενεράτο και στη Μονή Παλιανής. Το βαθύ τμήμα του φαραγγιού είναι πολύ μικρό σε μήκος (περίπου 500m), αλλά η ομορφιά του δεν αφήνει ανεπηρέαστο τον επισκέπτη του, παρόλο που έχει υποστεί μεγάλη μόλυνση από την ανθρώπινη δραστηριότητα.
Το Αχεντριανό φαράγγι βρίσκεται 52km νότια του Ηρακλείου, έχει μήκος περίπου 8km και καταλήγει στην παραλία στο Μαριδάκι. Διασχίζει το άνυδρο τοπίο των Αστερουσίων που χαρακτηρίζεται από γυμνά βουνά και βοσκότοπους. Στο μεγαλύτερο του μήκος είναι εύκολα προσβάσιμο, αλλά η κατάβαση του ως τη θάλασσα απαιτεί εξοπλισμό καθώς διακόπτεται απότομα από το ρήγμα των Αστερουσίων.