Στο Ηράκλειο υπάρχουν πολλά φαράγγια, με τα περισσότερα από αυτά να διασχίζουν τους όγκους του Ψηλορείτη και των Αστερουσίων Ορέων. Τα Αστερούσια διαθέτουν υπέροχα πεζοπορικά φαράγγια, με πιο σημαντικά του Αγιοφάραγγου, του Μάρτσαλου και του Τράφουλα. Ωστόσο, το διασημότερο φαράγγι είναι του Γάφαρη στον Ψηλορείτη, που διασχίζει το μαγευτικό δάσος του Ρούβα. Άλλα φαράγγια του Ψηλορείτη είναι του Κρουσώνα, μέσα από το οποίο διερχόταν το Μινωικό μονοπάτι για το Ιδαίον Άντρον, του Βρωμονερού, το Βοριζανό και τα δύο μικρά φαράγγια των Ασιτών. Κοντά στην πόλη, υπάρχουν τα καταπράσινα φαράγγια του Καρτερού, το Κουναβιανό, το Αρχανιώτικο, του Αλμυρού και του Βενεράτου. Στις δυτικές υπερώιες των Λασιθιώτικων βουνών υπάρχουν επίσης τα φαράγγια της Ρόζας, της Αμπέλου, της Αποτύπωσης και κοντά στη Χερσόνησο το φαράγγι του Αποσελέμη.
Εκτός από τα περιπατητικά αυτά φαράγγια, κυρίως η περιοχή των Αστερουσίων Ορέων στο νότιο Ηράκλειο φιλοξενεί πολλά τεχνικά φαράγγια, που έχουν ασφαλιστεί και χρησιμοποιούνται συχνά για την εκπαίδευση νέων canyoners.
Γωνιανό Φαράγγι 
Το Γωνιανό φαράγγι είναι η μοναδική δίοδος που συνδέει τον Σκλαβόκαμπο και τις Γωνιές με την Τύλισο κι από εδώ περνάει ο δρόμος για Ανώγεια. Το μήκος του είναι 3 χλμ. και είναι φαρδύ σχετικώς και ευθύγραμμο.
Το φαράγγι Ψαρό Νερό βρίσκεται 55km νοτιοανατολικά του Ηρακλείου. Είναι ένα απροσπέλαστο μικρό φαράγγι με μεγάλους καταρράκτες, πολύ γνωστό σε όσους ασχολούνται με καταρρίχηση φαραγγιών με σχοινιά (canyoning).
Λίγα μέτρα ανατολικά του Φαραγγιού του Τσούτσουρα ανοίγεται σαν μία στενή μαχαιριά στο μέτωπο της γης το μικρότερο, αλλά εξίσου εντυπωσιακό φαράγγι της Τρούλας. Είναι εξίσου εντυπωσιακό με πολλούς και όμορφους καταρράκτες στο διάβα του που ο μεγαλύτερος έχει ύψος 15 μέτρων ενώ ακολουθούν ακόμα 15 μικρότεροι.
Το απροσπέλαστο και άγριο φαράγγι Μεσοσφήνι βρίσκεται 55km νότια του Ηρακλείου, σε μια απομονωμένη περιοχή δυτικά του παραλιακού οικισμού των Τριών Εκκλησιών. Η είσοδος του βρίσκεται σε ύψος 450m, κοντά στο χωριό Μουρνιά, στα Αστερούσια Όρη. Στην έξοδο, 2km νοτιότερα, σχηματίζεται η πανέμορφη παραλία του Βοιδομάτη, στην οποία καταλήγει χωματόδρομος από τις Τρεις Εκκλησιές.
Το φαράγγι του Αναποδάρη σχηματίζεται στο τελικό τμήμα του μεγαλύτερου ποταμού της Κρήτης, του Αναποδάρη που συλλέγει τα νερά του κεντρικού νομού Ηρακλείου και της νότιας Δίκτης.
Το φαράγγι της Εθιάς, γνωστό ως Βορνό Φαράγγι, βρίσκεται στα νότια του Νομού Ηρακλείου, στην περιοχή των Αστερουσίων Όρεων. Ξεκινάει κοντά στο παραδοσιακό χωριό Εθιά και, αφού σκίσει τα Αστερούσια με κατεύθυνση προς τον Βορρά, ρίχνει τα λιγοστά νερά του (το χειμώνα) μέσα στην πεδιάδα της Μεσαράς, ανάμεσα στα χωριά Ροτάσι και Μεσοχώρι.
Το Λυγιοφάραγγο αποτελεί ένα από τα λίγα φαράγγια των Ανατολικών Αστερουσίων που μπορεί κάποιος να περπατήσει μέχρι τη θάλασσα χωρίς να χρειαστεί τεχνικό εξοπλισμό. Τα τελευταία χρόνια έχει σηματοδοτηθεί η διαδρομή που μας μεταφέρει από τον Αχεντριά ως την αρχή του φαραγγιού και στη συνέχεια στο Μαριδάκι.
Ένα από τα πιο εντυπωσιακά και μεγαλύτερα σε μήκος φαράγγια όλης της Κρήτης είναι το φαράγγι με το κακόηχο όνομα Ψωράρης. Βρίσκεται στην οροσειρά της Δίκτης πάνω από το χωριό Ξενιάκος Ηρακλείου και η αρχή του είναι στο οροπέδιο Παράσυρτα. Στα Παράσυρτα μας οδηγούν τρεις διαφορετικοί ορεινοί δρόμοι και οι τρεις μοναδικής ομορφιάς. Από το οροπέδιο Λασιθίου και το χωριό Καμινάκι, από το Γεράκι Πεδιάδος αλλά και από το Κατωφύγι Βιάννου.
