Στο Ηράκλειο υπάρχουν πολλά φαράγγια, με τα περισσότερα από αυτά να διασχίζουν τους όγκους του Ψηλορείτη και των Αστερουσίων Ορέων. Τα Αστερούσια διαθέτουν υπέροχα πεζοπορικά φαράγγια, με πιο σημαντικά του Αγιοφάραγγου, του Μάρτσαλου και του Τράφουλα. Ωστόσο, το διασημότερο φαράγγι είναι του Γάφαρη στον Ψηλορείτη, που διασχίζει το μαγευτικό δάσος του Ρούβα. Άλλα φαράγγια του Ψηλορείτη είναι του Κρουσώνα, μέσα από το οποίο διερχόταν το Μινωικό μονοπάτι για το Ιδαίον Άντρον, του Βρωμονερού, το Βοριζανό και τα δύο μικρά φαράγγια των Ασιτών. Κοντά στην πόλη, υπάρχουν τα καταπράσινα φαράγγια του Καρτερού, το Κουναβιανό, το Αρχανιώτικο, του Αλμυρού και του Βενεράτου. Στις δυτικές υπερώιες των Λασιθιώτικων βουνών υπάρχουν επίσης τα φαράγγια της Ρόζας, της Αμπέλου, της Αποτύπωσης και κοντά στη Χερσόνησο το φαράγγι του Αποσελέμη.
Εκτός από τα περιπατητικά αυτά φαράγγια, κυρίως η περιοχή των Αστερουσίων Ορέων στο νότιο Ηράκλειο φιλοξενεί πολλά τεχνικά φαράγγια, που έχουν ασφαλιστεί και χρησιμοποιούνται συχνά για την εκπαίδευση νέων canyoners.
Φαράγγι Δοξασμένος 
Τεχνικό φαράγγι των Αστερουσίων με βόρειο προσανατολισμό στην περιοχή νοτιοδυτικά του χωριού Φουρνοφάραγγο που ξεκινάει από την τοποθεσία Καλόλαγκο. Αποτελεί ένα από τα πέντα παράλληλα τεχνικά φαράγγια της περιοχής (Παστρικός, Λιχνιστής, Καλάλαγκα, Δοξασμένος, Ριζόσκαλο). Το φαράγγι έχει 14 καταβάσεις με τη μεγαλύτερη κατάβαση να έχει ύψος 30 μέτρα.
Το Φαραγγούλι των Βοριζίων βρίσκεται στον Ψηλορείτη, στην περιφέρεια του χωριού Βορίζια. Αποτελεί ένα από τα τρία παράλληλα φαράγγια της περιοχής, με πιο γνωστό από όλα το μεγάλο Βοριζανό Φαράγγι. Το μικρότερο και πιο άγνωστο είναι το Φαραγγούλι που ξεκινά μέσα ακριβώς από τα σπίτια του χωριού και ανηφορίζει απότομα πάνω.
Στο χωριό Καραβάδος (Καραβάδω) Ηρακλείου κρύβεται ένα μικρό φαράγγι που είναι παντελώς άγνωστο. Το φαράγγι του Αργουλιδιά. Το όνομά του το οφείλει στις πολλές αγριελιές (αργουλίδες στην Κρήτη) που συναντάμε στο φαράγγι, τη βλάστηση του οποίου συμπληρώνουν οι χαρουπιές, οι σφάκες και τα πολλά πλατάνια.
Τεχνικό φαράγγι των Αστερουσίων με βόρειο προσανατολισμό στην περιοχή νοτιοδυτικά του χωριού Φουρνοφάραγγο. Αποτελεί ένα από τα πέντα παράλληλα τεχνικά φαράγγια της περιοχής (Παστρικός, Λιχνιστής, Καλάλαγκα, Δοξασμένος, Ριζόσκαλο).
Το φαράγγι των Καμαρών, γνωστό ως Καμαραϊκό Φαράγγι ή Φάραγγα των Καμαρών, είναι το μεγαλύτερο φαράγγι στην περιοχή του χωριού Καμάρες της επαρχίας Πυργιωτίσσης στη νότια πλευρά του Ψηλορείτη.
