Η Κρήτη έχει περιορισμένους υδάτινους πόρους, λόγω της γεωγραφικής της θέσης και των καιρικών φαινομένων που επικρατούν. Για την επάρκεια του νησιού, κατασκευάζονται φράγματα και τεχνητές δεξαμενές, που σε σύντομο χρόνο μετατρέπονται σε σημαντικούς υδροβιότοπους, εμπλουτίζοντας τη βιοποικιλότητα του νησιού.
Η μεγαλύτερη φυσική λίμνη της Κρήτης βρίσκεται στον Κουρνά Αποκορώνου, όπου υπάρχει διαμορφωμένο παρατηρητήριο πτηνών. Μικρές αλλά σημαντικές φυσικές λίμνες με νερό όλο το χρόνο βρίσκονται στον Τερσανά Χανίων, στο Μοχό και στο Θραψανό, ενώ εποχικές λίμνες βρίσκονται στην Ορνέ, στο Παρακαλούρι, στη Ζίρο, στον Ομαλό Βιάννου, στον Αχεντριά, στο Στρούμπουλα, σε διάφορα οροπέδια του Μιραμπέλου, στη λίμνη του Διγενή στη Γέργερη και σε πολλά άλλα σημεία. Τεχνητές λίμνες που μπορεί κάποιος να παρατηρήσει πουλιά βρίσκονται στην Αγυιά Χανίων, στα μεγάλα φράγματα Μπραμιανών, Αποσελέμη, Φανερωμένης, Ποταμών και στα πολυάριθμα μικρά φράγματα της ενδοχώρας του Ηρακλείου, ενώ αξιόλογο σημείο για βόλτα είναι η λίμνη του Ζαρού.
Λίμνη Λιβάδας στο Θραψανό 
Η λίμνη της Λιβάδας βρίσκεται στην ομώνυμη περιοχή 1 χλμ βόρεια του χωριού Θραψανού και αποτελεί ένα από τα αγαπημένα μέρη των ντόπιων για περίπατο. Η έκταση της είναι μόλις 21 στρέμματα, αλλά αποτελεί έναν σημαντικό υδροβιότοπο της περιοχής, όπου έχουν παρατηρηθεί περισσότερα από 130 είδη πτηνών.
Λίγο πάνω και νότια του χωριού Αχεντριάς (Οχεντριάς, το χωριό με τις όχεντρες) Ηρακλείου βρίσκεται η λίμνη του Τούρκου ο Λάκκος ή Κολυμπάς. Πρόκειται για τη μόνη φυσική λίμνη σε όλη την οροσειρά των Αστερουσίων και αποτελεί σημαντικό βιότοπο. Σε αρκετά μεγάλο υψόμετρο, δημιουργείται σε ένα μικρό κοίλωμα γης που δημιουργεί ο φλύσχης των Αστερουσίων.
Στον Ομαλό, εκτός από το γραφικό ξωκλήσι του Αγίου Πνεύματος, δε θα βρείτε καμιά άλλη υποδομή. Το οροπέδιο χρησιμοποιείται μόνο από τους βοσκούς της περιοχής, τους θερινούς μήνες. κάθε χειμώνα το οροπέδιο ντύνεται στα λευκά, κάνοντας το τοπίο μαγευτικό. Όταν τα χιόνια λιώνουν, στο κέντρο του οροπεδίου σχηματίζεται μια μικρή λίμνη, η οποία διατηρείται ως το καλοκαίρι.
Η μικρή λίμνη της Μαχαιρίδας βρίσκεται στην περιοχή του Τερσανά Ακρωτηρίου, μόλις 14 χλμ βορειοανατολικά των Χανίων και δίπλα στην εκπληκτική παραλία της Μαχαιρίδας. Αποτελεί μια εντυπωσιακή καρστική δολίνη, όπου αναβλύζουν πηγές με υφάλμυρο νερό.
Τα Δαμάνια είναι ένα μικρό και ήσυχο χωριό στο πιο γόνιμο κομμάτι της επαρχίας Μονοφατσίου Ηρακλείου. Ο πληθυσμός του αποτελείται εξ’ ολοκλήρου από πρόσφυγες που ήρθαν μετά τη μικρασιατική καταστροφή στην Κρήτη. Το 2003 το χωριό απέκτησε τη δική του λίμνη με την κατασκευή φράγματος στο ποτάμι που κυλά δυτικά του οικισμού και αποτελεί παραπόταμο του Αναποδάρη Ποταμού.
Το φράγμα των Αμουργελλών βρίσκεται σε υψόμετρο 300μ., 30 χλμ νότια της πόλης του Ηρακλείου και 1 χλμ νότια του χωριού Αμουργέλλες. Έχει έκταση 150 στρεμμάτων και αποτελεί ένα από τα μεγάλα φράγματα της περιοχής του Αρκαλοχωρίου.
Στο Οροπέδιο της Ζίρου και ακριβώς δίπλα στον ομώνυμο οικισμό συναντάμε ένα πολύ μικρό υδροβιότοπο εκτάσεως μόλις μισού στρέμματος. Αυτή η μικρή λιμνούλα είναι εξαιρετικά σημαντική για την βιοποικιλότητα της ξηροθερμικής Ανατολικής Κρήτης, καθώς οποιαδήποτε πηγή γλυκού νερού είναι υπερπολύτιμη.
Στην καρδιά του Πάνω Μεραμπέλλου στο Λασίθι, της πιο άνυδρης περιοχής όλης της Κρήτης το μόνο που δε θα περίμενε να συναντήσει κάποιος είναι μια φυσική λίμνη με γλυκό νερό. Κι όμως στο χωριό Κουρούνες υπάρχει μία.
