Το καλοκαίρι του 1798 ο Ναπολέων Βοναπάρτης, κατά την εκστρατεία του κατά των Μαμελούκων στην Αίγυπτο, λέγεται πως διέμεινε σε ένα σπίτι στην Ιεράπετρα. Κανείς δεν τον πήρε χαμπάρι, μέχρι το επόμενο πρωί και αφού είχε αναχωρήσει για τη συνέχεια του ταξιδιού, όταν οι άνθρωποι που τον φιλοξένησαν είδαν ένα σημείωμα που έγραφε στα Γαλλικά «Αν θέλετε να μάθετε ποιος ήταν ο ξένος σας, μάθετε ότι είμαι ο Ναπολέων Βοναπάρτης».
Το μοναστήρι του Άξιον Εστί είναι κτισμένο σε λόφο βόρεια της Ιεράπετρας, σε απόσταση 2km από αυτή. Το ακριβές όνομα της μονής είναι Ιερό Γυναικείο Κοινόβιο Ησυχαστήριο της Αναστάσεως του Κυρίου και της Υπεραγίας Θεοτόκου «Το Άξιόν Εστι».
Η Μονή του Αγιασμένου βρίσκεται 2km βόρεια της Ιεράπετρας, κοντά στον κεντρικό δρόμο που συνδέει την πόλη με τη Παχειά Άμμο. Ο ναός του μοναστηριού είναι αφιερωμένος στους Αγίους Πάντες και εδώ βρισκόταν στα τέλη του 19ου αιώνα η οικία του Επισκόπου Ιεράς και Σητείας.
Η Αρχαιολογική Συλλογή Ιεράπετρας άρχισε να συγκροτείται στα τέλη του 19oυ αιώνα, όταν φιλάρχαιοι κάτοικοι της πόλης ίδρυσαν το Φιλεκπαιδευτικό Σύλλογο Ιεράπετρας, με σκοπό την περισυλλογή και τη διαφύλαξη των αρχαίων της περιοχής και τη δημιουργία μουσειακής συλλογής.
Το τζαμί της Ιεράπετρας είναι κτισμένο στην παλιά πόλη (Κάτω Μερά) περίπου στα τέλη του 19ου αώνα, όταν οι Οθωμανοί κατέλαβαν και τροποποίησαν την εκκλησία του Αγίου Ιωάννη. Είναι μεγάλο κτίριο και ακόμη σε πολύ καλή κατάσταση, που φέρει επιγραφή από το Κοράνι σε μαρμάρινη πλάκα στην είσοδο.
Ένα από τα μνημεία που αναδεικνύει την ακμή της αρχαίας Ιεράπετρας ήταν η «ναυμαχία», ένα θαλάσσιο θέατρο όπου τελούνταν αιματηρές παραστάσεις ναυμαχιών από φυλακισμένους και δούλους της Ρωμαϊκής Αυτοκρατορίας και αποτελούσε ουσιαστικά τη μεταφορά σε θαλάσσιο περιβάλλον των μαχών στις αρένες.
Ο δίκλιτος ναός του Αφέντη Χριστού και του Αγίου Χαραλάμπους βρίσκεται στη συνοικία της Κάτω Μεράς, στο λιμάνι της Ιεράπετρας και πολύ κοντά στο φρούριο Καλές. Είναι ο αρχαιότερος ναός της πόλης, ο οποίος έχει διαμορφωθεί στη σημερινή του μορφή ως αποτέλεσμα διαδοχικών επεμβάσεων.
Ο ναός του Αγίου Γεωργίου στην Ιεράπετρα είναι ο σημαντικότερος της πόλης και ο Άγιος Γεώργιος είναι πολιούχος της. Ο ναός είναι τρίκλιτος με τρούλο πάνω σε ψηλό τύμπανο και ακολουθεί τα αρχιτεκτονικά πρότυπα της Τουρκοκρατίας και θυμίζει αρκετά τον Άγιο Τίτο στο Ηράκλειο.